2019 Fiscal Year Research-status Report
HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御
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19K07591
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
白川 康太郎 京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | HIV-1 / 潜伏感染 / CAGE法 / CRISPRスクリーニング |
Outline of Annual Research Achievements |
HIVGKOを感染させたJurkatT細胞モデルを用いて潜伏感染細胞の遺伝子発現プロファイルをCAGE法により解析した。非感染細胞に比較して潜伏感染細胞で31種の遺伝子発現の低下を同定したが、遺伝子発現が増加した遺伝子は認めなかった。これらの遺伝子のうち非感染細胞でSPP1とAPOEが増加していたことは、そのノックダウンにより感染細胞が低下することから、これらの遺伝子発現がHIV-1感染に抑制性に機能していることを示唆している。 またこの潜伏感染細胞モデルを用いてCRISPRスクリーニングを行い、潜伏感染の再活性化に関わる遺伝子群を同定した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定した潜伏感染細胞で特異的に遺伝子発現の変化があった遺伝子の機能について解明できた。CRISPRスクリーニングの予備実験が終了し、潜伏感染再活性化における遺伝子群を同定できているため。
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Strategy for Future Research Activity |
CRISPRスクリーニングで同定した遺伝子群の機能解析を行う。
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Causes of Carryover |
次年度の試薬代に使用します。
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