• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Research-status Report

HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御

Research Project

Project/Area Number 19K07591
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

白川 康太郎  京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
KeywordsHIV-1 / 潜伏感染 / CAGE法 / CRISPRスクリーニング
Outline of Annual Research Achievements

HIVGKOを感染させたJurkatT細胞モデルを用いて潜伏感染細胞の遺伝子発現プロファイルをCAGE法により解析した。非感染細胞に比較して潜伏感染細胞で31種の遺伝子発現の低下を同定したが、遺伝子発現が増加した遺伝子は認めなかった。これらの遺伝子のうち非感染細胞でSPP1とAPOEが増加していたことは、そのノックダウンにより感染細胞が低下することから、これらの遺伝子発現がHIV-1感染に抑制性に機能していることを示唆している。
またこの潜伏感染細胞モデルを用いてCRISPRスクリーニングを行い、潜伏感染の再活性化に関わる遺伝子群を同定した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定した潜伏感染細胞で特異的に遺伝子発現の変化があった遺伝子の機能について解明できた。CRISPRスクリーニングの予備実験が終了し、潜伏感染再活性化における遺伝子群を同定できているため。

Strategy for Future Research Activity

CRISPRスクリーニングで同定した遺伝子群の機能解析を行う。

Causes of Carryover

次年度の試薬代に使用します。

  • Research Products

    (3 results)

All 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Buck Institute for Research on Aging(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Buck Institute for Research on Aging
  • [Presentation] HIV-1 latent infection does not trigger cellular transcriptional responses in T-cells2020

    • Author(s)
      Hiroyuki Matsui, Kotaro Shirakawa, Shigeki Hirabayashi, Anamaria D. Sarca, Hirofumi Fukuda, Yasuhiro Murakawa, Emilie Battivelli, Eric Verdin, Akifumi Takaori-Kondo
    • Organizer
      Keystone Symposia 2020 HIV Pathogenesis and Cure X6
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] Verdin Lab website

    • URL

      https://www.buckinstitute.org/lab/verdin-lab/

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi