• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御

Research Project

Project/Area Number 19K07591
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

白川 康太郎  京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
KeywordsHIV感染症 / 潜伏感染 / 再活性化 / トランスクリプトーム / mTOR経路 / CRISPRスクリーン
Outline of Annual Research Achievements

HIVGKOを感染させたJurkatT細胞モデルを用いて潜伏感染細胞の遺伝子発現プロファイルをCAGE法により解析した。非感染細胞に比較して潜伏感染細胞で31種の遺伝子発現の低下を同定したが、遺伝子発現が増加した遺伝子は認めなかった。これらの遺伝子のうち非感染細胞でSPP1とAPOEが増加していたことは、そのノックダウンにより感染細胞が低下することから、これらの遺伝子発現がHIV-1感染に抑制性に機能していることを示唆している。さらに潜伏感染細胞とウイルス産生性感染細胞でmTOR経路の遺伝子群の発現に差があることに注目し、mTOR経路の発現が低い細胞で潜伏感染が多いことを発見し報告した(Matsui et al., Journal of Virology, 2021)。以上の知見から、感染する細胞の遺伝子発現の状態が、ウイルス感染が起こるかどうか、さらにウイルスのインテグレーション後にウイルス産生につながるか、転写が停止し潜伏感染の状態に陥るかに影響していると考えられた。
またこの潜伏感染細胞モデルを用いてCRISPRスクリーニングを行い、潜伏感染の再活性化に関わる遺伝子群を同定した。これらの遺伝子をCRISPRでノックアウトすることによりウイルス再活性化が起こることを発見し研究を継続している。

  • Research Products

    (7 results)

All 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) Presentation (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Buck Institute for Research on Aging(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Buck Institute for Research on Aging
  • [Journal Article] CAGE-Seq Reveals that HIV-1 Latent Infection Does Not Trigger Unique Cellular Responses in a Jurkat T Cell Model2021

    • Author(s)
      Matsui Hiroyuki、Shirakawa Kotaro、Konishi Yoshinobu、Hirabayashi Shigeki、Sarca Anamaria Daniela、Fukuda Hirofumi、Nomura Ryosuke、Stanford Emani、Horisawa Yoshihito、Kazuma Yasuhiro、Matsumoto Tadahiko、Yamazaki Hiroyuki、Murakawa Yasuhiro、Battivelli Emilie、Verdin Eric、Koyanagi Yoshio、Takaori-Kondo Akifumi
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 95 Pages: 1~18

    • DOI

      10.1128/JVI.02394-20

  • [Journal Article] APOBEC3B is preferentially expressed at the G2/M phase of cell cycle2021

    • Author(s)
      Hirabayashi Shigeki、Shirakawa Kotaro、Horisawa Yoshihito、Matsumoto Tadahiko、Matsui Hiroyuki、Yamazaki Hiroyuki、Sarca Anamaria Daniela、Kazuma Yasuhiro、Nomura Ryosuke、Konishi Yoshinobu、Takeuchi Suguru、Stanford Emani、Kawaji Hideya、Murakawa Yasuhiro、Takaori-Kondo Akifumi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 546 Pages: 178~184

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.02.008

  • [Journal Article] Alternative splicing of APOBEC3D generates functional diversity and its role as a DNA mutator2021

    • Author(s)
      Takei Hisashi、Fukuda Hirofumi、Pan Gilbert、Yamazaki Hiroyuki、Matsumoto Tadahiko、Kazuma Yasuhiro、Fujii Masanori、Nakayama Sohei、Kobayashi Ikei S.、Shindo Keisuke、Yamashita Riu、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Kobayashi Susumu S.
    • Journal Title

      International Journal of Hematology

      Volume: 112 Pages: 395~408

    • DOI

      10.1007/s12185-020-02904-y

  • [Journal Article] Critical role of PP2A-B56 family protein degradation in HIV-1 Vif mediated G2 cell cycle arrest2021

    • Author(s)
      Nagata Kayoko、Shindo Keisuke、Matsui Yusuke、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 527 Pages: 257~263

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.04.123

  • [Journal Article] FRET-Based Detection and Quantification of HIV-1 Virion Maturation2021

    • Author(s)
      Sarca Anamaria D.、Sardo Luca、Fukuda Hirofumi、Matsui Hiroyuki、Shirakawa Kotaro、Horikawa Kazuki、Takaori-Kondo Akifumi、Izumi Taisuke
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: 1-13

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.647452

  • [Presentation] HIV-1潜伏感染の成立と維持に関与する分子機構2021

    • Author(s)
      白川康太郎
    • Organizer
      第35回日本エイズ学会学術集会・総会

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi