Functional analysis of CCDC26, a noncoding RNA related to myeloid leukemia, and search of a target for treatment of tumor

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K07667
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50010:Tumor biology-related
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: Hirano Tetsuo 広島大学, 統合生命科学研究科(総), 助教 (50228805)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 原田 浩徳 東京薬科大学, 生命科学部, 教授 (10314775) ; 山崎 岳 広島大学, 統合生命科学研究科(総), 教授 (30192397) ; 根平 達夫 広島大学, 統合生命科学研究科(総), 准教授 (60321692) ; 石田 敦彦 広島大学, 統合生命科学研究科(総), 教授 (90212886)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 非コードRNA / 骨髄性白血病細胞 / 遺伝子発現調節 / グロビン

Outline of Final Research Achievements

Analysis of proteins that interact with CCDC26 revealed that these were identified as Vimentin (a cytoskeletal protein), HNRNPC (splicing-related RNA-binding protein), and CBX1 (heterochromatin-associated protein). Specific binding of Vimentin and CCDC26 RNA was confirmed by RNA immunoprecipitation. In order to identify the RNA sequence required for binding, three separate regions of CCDC26 RNA were tested for their ability to bind in vitro to Vimentin protein. As a result, the region of 428-1076 base of CCDC26-RNA is found to bind to Vimentin protein.

Free Research Field

分子細胞生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞局在の異なる複数のタンパク質と相互作用する単独で様々な機能を有する多機能lncRNAであると考えられるが、我々が知る限り、これまでにそのようなlncRNAの概念はまだ提唱されておらず、この点で大きな学術的な意義がある。また、lncRNAによるがん関連遺伝子及びグロビンタンパク質群の発現制御に関する知見は、基礎から臨床応用に至るまで、与える影響は大きい。非コードRNA CCDC26による遺伝子発現制御機構がいっそう明らかになることにより、白血病治療及び異常ヘモグロビン症の治療戦略に役立つ可能性が示された。