2021 Fiscal Year Annual Research Report
Development of liquid biopsy for early diagnosis of pancreatic cancer using next generation sequence with molecular barcoding detection.
Project/Area Number |
19K07707
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
三方 林太郎 千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (60596146)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
弘津 陽介 地方独立行政法人山梨県立病院機構山梨県立中央病院(がんセンター局ゲノム解析センター), ゲノム解析センター, チーフ研究員 (10793838)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | 膵癌 / K-RAS変異 / NGS / リキッドバイオプシー |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、膵癌などの胆膵腫瘍性病変を有する症例の血液、消化液等を対象としてNGSを用いた超高感度システムによる遺伝子解析から早期診断のバイオマーカーを探索し、内視鏡で採取可能な十二指腸液等の消化液を用いた早期診断法の開発を目的とする。令和1-2年度は、膵癌症例68例を対象として解析を行い、血液サンプルおよび手術検体10例、FNA検体19例、また一部の症例で十二指腸液を採取し解析を行った。NGS解析を用いる前段階としてKRAS遺伝子変異をデジタルPCRにより解析し、K-RAS変異は7例(10.3%)において検出された。血中K-RAS変異が陰性であった膵癌8症例(StageⅡ:4例、StageⅣ:4例)でcirculating tumor cells (CTC) の解析も行い、StageⅡで3例(75%)、StageⅣでは2例(50%)でCTCが検出され、膵癌の早期診断に血中CTCが有用な可能性が示唆された。十二指腸液の解析、遺伝子変異解析に可能なDNA量の回収が可能であることを確認できたが、口腔や食道由来の扁平上皮や消化管粘膜由来と想定される細胞も多く含まれ、NGS解析を施行したものの遺伝子異常の同定が難しかった。令和3年度はリキッドバイオプシーの観点から胆汁に着目し、胆膵癌パネル(遺伝子数60)を用いてNGS解析を行った。保存されていた34例の胆汁細胞診検体のゲノム解析では30例(91%)でOncogenic mutationが検出された。2018年4月~2021年3月にかけて採取した悪性胆道狭窄症例43例の胆汁の解析では20例(46.5%)でOncogenic mutationが検出され、胆汁遺伝子解析を用いた診断が有用な可能性が示唆された。これらの結果から、血液や胆汁などの液状検体を用いた遺伝子変異解析が、胆膵癌の早期診断に有用な可能性が示唆された。
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[Journal Article] Analysis of circulating cell-free DNA after endoscopic ultrasound-guided fine needle aspiration in pancreatic ductal adenocarcinoma.2021
Author(s)
Asano K, Mikata R, Chiba T, Kan M, Maruta S, Yamada T, Miura Y, Shima Y, Sensui M, Nagashima H, Yokoyama M, Ohyama H, Kusakabe Y, Yasui S, Sugiyama H, Ohno I, Kato J, Takano S, Ohtsuka M, Kato N.
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Journal Title
Pancreatology
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 胆汁ゲノムプロファイル解析は手術不能悪性胆道狭窄例において分子標的治療薬探索に有用である2021
Author(s)
大山広,加藤直也, 小俣政男, 弘津陽介, 雨宮健司, 廣瀬純穂, 三方林太郎, 小山敏雄, 鷹野敦史, 飯室勇二, 望月仁
Organizer
第57回日本胆道学会学術集会
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[Presentation] 胆道疾患における胆汁を用いたLiquid biopsyの有用性の検討2021
Author(s)
三浦義史, 大山広, 三方林太郎, 杉山晴俊, 安井伸, 大野泉, 日下部裕子, 弘津陽介, 雨宮健司, 望月仁, 千葉哲博, 池田純一郎, 大塚将之, 小俣政男, 加藤直也
Organizer
JDDW 2021(第63回日本消化器病学会大会)