2021 Fiscal Year Final Research Report

Development of diagnostic technique of pancreatic cancer by using liquid biopsy targeted DNA methylation markers

Research Project

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Project/Area Number	19K07771
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research Institution	Tohoku University
Principal Investigator	Gu Zhaodi 東北大学, 医学系研究科, 非常勤講師 (40451520)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	元井冬彦山形大学, 医学部, 教授 (30343057) 畠達夫東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (30806237) 福重真一東北大学, 医学系研究科, 特任教授 (90192723)
Project Period (FY)	2019-04-01 – 2022-03-31
Keywords	癌 / ゲノム / 遺伝子 / 膵癌 / DNAメチル化 / リキッドバイオプシー / デジタルPCR / qMSP
Outline of Final Research Achievements	In this study, we examined the development of a liquid biopsy technique targeting DNA methylation of six genes that are hypermethylated and transcriptionally repressed in pancreatic cancer by MeTA, our proprietary hypermethylated gene search method. The amount of cfDNA obtained from 2 mL of plasma from patients with pancreatic diseases including pancreatic cancer averaged 17.4 ng, and higher molecular weight band ladders were not detected. Although DNA methylation is difficult to detect at this time, methods of sampling plasma and methylated DNA enrichment need to be investigated. On the other hand, analysis of LHX6 gene identified by MeTA revealed that transcriptional repression by hypermethylation plays an important role in pancreatic cancer cell growth.
Free Research Field	分子病理学
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	MeTAにより同定された膵癌特異的メチル化遺伝子LHX6が膵癌の増殖に関係することから、膵癌の診断、治療のターゲットになる可能性もあり、さらなる検討が必要である。また、本研究から膵疾患患者の血漿から得られるcfDNA量、品質では、現状でDNAメチル化解析に用いることは困難であることがわかった。DNAメチル化を用いたリキッドバイオプシーは、膵癌の早期診断に重要であることから、膵疾患のcfDNAの量、質をカバーするあらたな方法を見つけ出す必要がある。