2021 Fiscal Year Annual Research Report
非肝炎ウイルス性肝細胞癌におけるレトロトランスポゾン変化の解明
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19K07777
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
別府 透 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 特定研究員 (70301372)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山下 洋市 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 准教授 (00404070)
中川 茂樹 熊本大学, 病院, 特任助教 (10594872)
山村 謙介 熊本大学, 病院, 非常勤診療医師 (10816507)
清住 雄希 熊本大学, 病院, 非常勤診療医師 (30827324)
宮田 辰徳 熊本大学, 病院, 非常勤診療医師 (80594887)
林 洋光 熊本大学, 病院, 助教 (80625773)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 肝細胞癌 / エピジェネティクス / DNAメチル化 / LINE-1 / Copy数 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は研究計画に基づき、切除凍結標本を用いたLINE-1のメチル化や増幅について検討することとした。非肝炎症例は少なく、切除サンプルに肝炎ウイルスを背景肝とした症例も含め検討することとした。症例数は11例で、男性8例 (72.3%)、B型肝炎3例（27.3%）C型肝炎6例（54.5%）、非肝炎性2例（18.2%）、肝硬変F4が2例(18.2%)であった。まず凍結切除標本の癌部、非癌部のLINE-1の増幅を検討した結果、癌部は58% [IQR:47-75]、非癌部は76%[IQR:75-78]と癌部において有意にLINE-1のメチル化が低値であった（p=0.0009）。参考までに、癌部のLINE-1メチル化を同じ症例におけるホルマリン固定サンプルと凍結切除標本で比べたところ、保存の違いによるLINE-1メチル化の差は認めなかった（p=0.32）。次に、LINE-1の増幅についてORF2をプライマーとして、HERVHをinternal controlとして用い、癌部と非癌部のLINE-1のcopy数について評価を行ったところ、両群間で有意差を認めなかった（p=0.70）。癌部のLINE-1メチル化とCopy数の関連については正の相関関係を認めた（r2=0.626, p=0.006）が、非癌部においては相関関係を認めなかった(r2=0.039, p=0.59)。背景肝毎のLINE-1のcopy数についても評価したが3群間に統計学的有意差を認めなかった(p=0.29)。本研究では動物実験モデルによる評価およびCopy数の増加と発癌遺伝子の関連に関する評価が行えておらず、今後の研究課題と考えている。
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Research Products
(5 results)
