2020 Fiscal Year Research-status Report
網羅的遺伝子解析と三次元タンパク構造解析を用いたウエスト症候群の基礎病態解析
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19K08285
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| Research Institution | Fujita Health University |
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Principal Investigator |
石原 尚子 藤田医科大学, 医学部, 講師 (30393143)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
稲垣 秀人 藤田医科大学, 総合医科学研究所, 講師 (70308849)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | West症候群 / 網羅的遺伝子解析 / タンパク３次元構造解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ウエスト症候群は主に乳児期に発症する予後不良なてんかん性脳症であり、その疾患多様性は幅広く、予後も様々である。本研究ではウエスト症候群およびその類縁である難治性てんかん性脳症を対象として網羅的遺伝子解析にて候補遺伝子を絞り込み、その病態解析をすすめるものである。
2020年度はウエスト症候群（10例）および類縁するてんかん性脳症（3例）の診療を行なった。基礎疾患は結節性硬化症が2例、潜因性が1例、残り10例のうち7例で原因同定された。潜因性を含めた4例は網羅的遺伝子解析中である。7例中3例は周産期障害、胎児感染症、急性脳症後であり、1例は染色体異常、3例は網羅的遺伝子解析にて原因遺伝子同定を行なった。1例は片側巨脳症を基礎疾患とし、眼球異常や皮膚異常を合併していたため、血液検体に加えて機能的半球離断術施行時に皮膚および脳検体を採取して解析を行ったところ、皮膚と脳からPIK3CA遺伝子のモザイク変異を同定した。残り2例は血液のトリオ検体に網羅的遺伝子解析を施行した。3例とも既報告の遺伝子であるが、1例は既報と比較して臨床像が重篤であり、その関連性について検討を進めている。
2019年度に網羅的遺伝子解析にて候補遺伝子Xを同定した症例について、遺伝子Xは母由来のmissense variantと父由来遺伝子上のde novoのsplice site variantを認めており、この２つのvariantについてmRNAを解析したところ、いずれもスプライシング異常による通常より短い異常産物が確認された。異常産物はそれぞれstop codonおよびframeshiftを新たに認め、機能への影響が示唆されたため、患者血液を用いて酵素活性測定をしたところ低下を認めたため、2020年度の日本人類遺伝学会にて発表し、現在論文化を進めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
網羅的遺伝子解析にて3例の原因遺伝子が同定された。いずれも既報告であるが、１例において臨床像が既報と異なるものであり、その表現型の差異について検討中である。
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| Strategy for Future Research Activity |
1. 新規症例の研究参加をすすめる。
2. 臨床検査データの集積と、原疾患別の治療経過および予後の評価を行なう。
3. 網羅的遺伝子解析実施例に対する臨床データと候補遺伝子のマッチング作業
4. 候補遺伝子の絞り込みが行なわれた症例について、その病態解析をすすめる。
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| Causes of Carryover |
次世代シーケンサー解析費用について、2019年度の解析症例や他の研究検体と同時に解析を行ない、当初予定している金額を下回ることになった。また昨年度はCOVID-19の影響で学会参加や出張会議がほとんど行われなかった。West症候群をはじめとする慢性疾患の発祥はCOVID-19の影響を受けず、臨床評価は随時行なっており、次年度にも新規症例の登録を行う予定である。これらの助成金は、次年度の新規症例の解析に充てる予定である
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