2021 Fiscal Year Annual Research Report
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19K08350
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
柴 徳生 横浜市立大学, 附属病院, 講師 (50600615)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 急性骨髄性白血病 / DNAメチル化 / ATAC-seq / micro RNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小児急性骨髄性白血病(AML)は小児がんにおいて最も予後不良な疾患の1つであり、様々な遺伝子異常を背景とするヘテロな疾患である。申請者らはこれまでの解析により、予後不良AMLの多くでPRDM16遺伝子が高発現となっていることを突き止め、重要なリスク因子として報告してきた。
令和3年度はPRDM16高発現であるNUP98-NSD1陽性AML症例の検体を用いて、PRDM16に対する抗体を利用してCHIP-seqを施行した。その結果、SKI、RUNX1等の既知のがん関連遺伝子に加え、神経系の発達に関与する遺伝子Yなど、AML発症に関わると考えられる複数の候補遺伝子を同定した。遺伝子Yの下流に座位しているRHOAキナーゼの阻害剤を用いて、AMLの細胞株に対して薬剤感受性試験を施行したところ、増殖抑制効果を確認した。また、ATAC-seqにて、PRDM16高発現遺伝子AML群ではプロモーター領域がオープンとなっていることを突き止め、同領域のDNA低メチル化とあわせ、PRDM16遺伝子自体のacitivity亢進によりAMLの難治化に寄与していることを同定した。PRDM16低発現群では、PRDM16遺伝子のプロモーター領域は閉じており、PRDM16遺伝子の活性化はないものと考えられた。さらに、様々な遺伝子背景をもつ小児AML48例でmicroRNAシーケンスを施行した。その結果、発現パターンから4つのクラスターに分類され、一部は既存の遺伝子異常と相関するものの、既存の遺伝子異常とは異なるクラスターを形成していた。症例数の関係もあり、明らかな予後予測に有用となる結果を得ることは出来なかった。今後、遺伝子異常や遺伝子発現データ、網羅的DNAメチル化のステータスとの照合を行い、統合的な解析を行い、予後に影響を及ぼすmiRNAの同定を目指す。
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[Journal Article] Genome-wide DNA Methylation Analysis in Pediatric Acute Myeloid Leukemia.2022
Author(s)
Yamato G, Kawai T, Shiba N, Ikeda J, Hara Y, Ohki K, Tsujimoto SI, Kaburagi T, Yoshida K, Shiraishi Y, Miyano S, Kiyokawa N, Tomizawa D, Shimada A, Sotomatsu M, Arakawa H, Adachi S, Taga T, Horibe K, Ogawa S, Hata K, Hayashi Y.
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Journal Title
Blood advances
Volume: in press
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Clinical significance of RAS pathway alterations in pediatric acute myeloid leukemia.2022
Author(s)
Kaburagi T, Yamato G, Shiba N, Yoshida K, Hara Y, Tabuchi K, Shiraishi Y, Ohki K, Sotomatsu M, Arakawa H, Matsuo H, Shimada A, Taki T, Kiyokawa N, Tomizawa D, Horibe K, Miyano S, Taga T, Adachi S, Ogawa S, Hayashi Y.
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Journal Title
Haematologica
Volume: 107(3)
Pages: 583-592
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Droplet digital polymerase chain reaction assay for the detection of the minor clone of KIT D816V in paediatric acute myeloid leukaemia especially showing RUNX1-RUNX1T1 transcripts.2021
Author(s)
Sasaki K, Tsujimoto S, Miyake M, Uchiyama Y, Ikeda J, Yoshitomi M, Shimosato Y, Tokumasu M, Matsuo H, Yoshida K, Ohki K, Kaburagi T, Yamato G, Hara Y, Takeuchi M, Kinoshita A, Tomizawa D, Taga T, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Hayashi Y, Matsumoto N, Ito S, Shiba N.
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Journal Title
British Journal of Haematology
Volume: 194(2)
Pages: 414-422
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Predisposition to prolonged neutropenia after chemotherapy for paediatric acute myeloid leukaemia is associated with better prognosis in the Japanese Paediatric Leukaemia/Lymphoma Study Group AML-05 study.2021
Author(s)
Aoki T, Takahashi H, Tanaka S, Shiba N, Hasegawa D, Iwamoto S, Terui K, Moritake H, Nakayama H, Shimada A, Koh K, Goto H, Kosaka Y, Saito AM, Horibe K, Kinoshita A, Tawa A, Taga T, Adachi S, Tomizawa D
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Journal Title
Br J Haematol.
Volume: 193
Pages: 176-180
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The outcomes of relapsed acute myeloid leukemia in children: Results from the Japanese Pediatric Leukemia/Lymphoma Study Group AML-05R study.2021
Author(s)
Moritake H, Tanaka S, Miyamura T, Nakayama H, Shiba N, Shimada A, Terui K, Yuza Y, Koh K, Goto H, Kakuda H, Saito A, Hasegawa D, Iwamoto S, Taga T, Adachi S, Tomizawa D.
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Journal Title
Pediatr Blood Cancer.
Volume: 68
Pages: e28736
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Clonal Evolution Pattern and Prognostic Significance of Clonal Architecture in KMT2A-Rearranged Acute Myeloid Leukemia.2021
Author(s)
Matsuo H, Yoshida K, Nannya Y, Ito Y, Saito S, Koga Y, Moritake H, Terui K, Kawaguchi K, Okamoto Y, Nakayama H, Kanno M, Hino M, Akane Y, Inoue A, Shimada A, Goto H, Ueno H, Takita J, Yamato G, Shiba N, Hayashi Y, Shiraishi Y, Miyano S, Kiyokawa N, Tomizawa D, Taga T, Tawa A, Ogawa S and Adachi S
Organizer
The 63rd American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition(virtual)
Int'l Joint Research
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[Presentation] Cytokine Analysis in 154 Patients with Transient Abnormal Myelopoiesis: Jccg JPLSG TAM-10 Clinical Study.2021
Author(s)
Yamato G, MD, Park MJ, Shimada A, Shiba N, Yamada Y, Terui K, Ito E, MD, Muramatsu H, Watanabe K, and Hayashi Y.
Organizer
The 63rd American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition(virtual)
Int'l Joint Research
