2021 Fiscal Year Annual Research Report
エピジェネティクスを用いた全ゲノム解析による遺伝性不整脈疾患の新規発症機序の解明
| Project/Area Number |
19K08566
|
|---|
| Research Institution | Nippon Medical School |
|---|
Principal Investigator |
村田 広茂 日本医科大学, 医学部, 助教 (30594014)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大野 聖子 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 部長 (20610025)
清水 渉 日本医科大学, 大学院医学研究科, 大学院教授 (50399606)
堀江 稔 滋賀医科大学, アジア疫学研究センター, 特任教授 (90183938)
相庭 武司 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, 研究所, 部長 (40574348)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
| Keywords | 遺伝性不整脈 / 心臓突然死 / エピジェネティクス / バイオインフォマティクス / 全ゲノムシークエンス |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
遺伝性不整脈疾患は、若年性心臓突然死の原因となる致死性不整脈を発症する疾患群である。従来健康で社会に貢献する世代を突然襲う疾患であり、それにより失われる文化経済的損害は多大なものである。これを未然に予防、治療するためには疾患の遺伝子基盤に基づく発症機序を正確に同定することが不可欠である。そこで本研究では、ターゲット領域遺伝子解析や全エクソン解析等によっても原因遺伝子、病原性バリアントを同定できなかった心臓突然死の家系を対象とし、全ゲノム解析を行った。現在までに国立循環器病研究センター等にて施行した7症例のシークエンスの結果から症例ごとに平均500万個のSNPと5千個の構造バリアントを検出し、研究初年度に構築した最新のエピジェネティクス・データベースを導入したカスタムメイドの解析パイプラインを用いてバイオインフォマティクス解析を行った。結果，心臓突然死の一家系で、PITX2-C4orf32遺伝子間領域に心臓突然死、洞不全症候群に関わる非コード領域異常を新たに同定し、学会報告した。研究2年目には同内容を日本循環器学会学術集会シンポジウムにて招致講演をした。その後、京都大学循環器内科と共同で患者由来iPS細胞を用いた機能解析を開始した。結果、同非コード領域は、PITX2の発現異常を生じる調節領域であることを明らかにし、再度学会報告を行った。この結果は、日本循環器学会および日本不整脈心電学会策定のガイドライン作成に生かされた。なお、研究責任者は、2020年改訂版不整脈薬物治療ガイドライン、2022年改訂版不整脈の診断とリスク評価に関するガイドラインの策定協力員として参加した。また、国立循環器研究センターより家系データを追加し、現在までに心臓突然死7家系の疾患原因となっていることを明らかにし、新規の遺伝子基盤に基づく疾患メカニズムとして学会発表した。現在、学術論文を共同執筆中である。
|
