2022 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of constitutive epimutations of tumor-suppressor genes in normal cells for breast cancer risk assessment
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19K09063
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| Research Institution | 株式会社関西メディカルネット(関西電力医学研究所) |
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Principal Investigator |
佐藤 史顕 株式会社関西メディカルネット(関西電力医学研究所), 外科(神経内分泌腫瘍・乳癌)研究部, 上級特別研究員 (20467426)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川島 雅央 京都大学, 医学研究科, 助教 (80766676)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 乳癌 / エピジェネティクス / リキッドバイオプシー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
構成的エピジェネティック変異(constitutive epimutation: 構成的EpM)とは、ある特定の疾病の易罹患性に関連した正常細胞内のエピジェネティック異常を示 す。BRCA1、hMLH1、Rb遺伝子の構成的EpMがそれぞれ、乳癌・卵巣癌、大腸癌、網膜芽細胞腫の発症に関連づけられている。本研究では、乳癌関連11遺伝子の胚 細胞系列病的変異の有無が調べられている乳癌症例1808症例の血液DNA標本と、健常者の血液DNA標本を用い、日本人女性の乳癌に対する構成的EpMマーカーを同 定する。そこから、胚細胞系列病的変異と構成的EpMとによる総合的な乳癌リスク評価法を開発する。乳癌関連11遺伝子のプロモーター領域の異常高メチル化を 検出する、プライマープローブセットをデザインした。公的ゲノムデータベースのNCBI-GEOより、非担がん個体のWBCの全ゲノムメチル化データを収集。乳癌組 織と乳癌細胞株の全ゲノムメチル化データは以前にpublish(Breast Cancer Res. 2016 Dec19;18(1):129)したデータを使用。それぞれの遺伝子の、プロモーター 領域(-2000bp~TSS~第1エクソン)で、非担癌個体の標本でほぼメチル化が内領域を抽出し、乳癌組織や乳癌細胞株でメチル化が一部の症例で認められる領域を選 出した。その領域にプライマープローブセットをデザインした。その検出系を検証している。また、京都大学乳腺外科のBORNバイオバンクには乳癌症例の血液標 本は多いが、乳癌のない個人のWBCも収集する必要がある。関西電力病院と隣接する中之島クリニックで乳癌の有無をマンモグラフィーと超音波で診断された個 人のWBC標本を収集する環境を整備中。
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