2020 Fiscal Year Research-status Report
癌幹細胞の観点から見た肝癌におけるゲノム不均一性の解明
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19K09145
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
石井 隆道 京都大学, 医学研究科, 特定病院助教 (70456789)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
河合 隆之 京都大学, 医学研究科, 客員研究員 (00813867)
小木曾 聡 京都大学, 医学研究科, 助教 (10804734)
上本 伸二 滋賀医科大学, 医学部, 学長 (40252449)
福光 剣 京都大学, 医学研究科, 特定病院助教 (70700516)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 肝癌 / ゲノム / ゲノムシークエンス / 混合型肝癌 / 胆管癌 / 肝細胞癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，肝癌において見られる腫瘍間不均一性および腫瘍内不均一性のメカニズ ムをゲノム変異の観点から解明することを目的としている.対象とする肝癌 は癌幹細胞との関連が示唆されている2種類の肝癌で，1. 肝細胞癌の中で胆管や完全区細胞のマーカーであるサイトケラチン19 (K19)を発現しているK19陽性肝細胞癌と，2. 混合型肝癌である.
本年度は，当科で切除されたK19陽性肝細胞癌及び混合型肝癌を検討し，その臨床病理学的背景や予後とも紐づけられた詳細なデータベースを作成した.特に混合型肝癌についてはその結果をまとめて２本の英文論文を発表した．
当科で肝切除した症例の中 で，21患者24結節で混合型肝癌と病理診断されているが13患者16結節から遺伝子を抽出し，全ゲノムシークエンスを終えた．一方，K19陽性肝細胞癌15例およびK19陰性肝細胞癌症例３例からでゲノムDNAを抽出し，全ゲノムシークエンスを終えた．
これら自施設のゲノムデータと，公開されている肝細胞癌及び肝内胆管癌のゲノムデータをInternational Cancer Gene Consortium (ICGC) より得て比較検討している．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の予定通り概ね順調に研究は進んでいる.
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| Strategy for Future Research Activity |
スーパーコンピューターを用いて，自施設で得られた全エクソンシークエンス（混合型肝癌とK19陽性肝細胞癌）と，公開されている肝細胞癌及び肝内胆管癌のエクソンシークエンスデータとを比較検討する．特に癌幹細胞との関連に注目しつつ，混合型肝癌やK19陽性肝細胞癌に特異的なドライバー遺伝子を同定することを試みる．
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