2021 Fiscal Year Annual Research Report
Understanding of the genomic evolution and cancer microenvironment to identify a susceptible marker to immune therapy for IHCC.
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19K09220
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
江口 英利 九州大学, 大学病院, 特別教員 (90527756)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 穣 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
三森 功士 九州大学, 大学病院, 教授 (50322748)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | CYT / サイトカイン / NK細胞 / RNA Seq / GZMA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
肝内胆管癌における腫瘍免疫応答寛容を誘導する代謝産物及び遺伝子群を明らかにするため、肝内胆管癌切除症例10例に対して、各切除組織の癌部より3-9ヶ所、非癌部より1ヶ所の合計74検体を採取し、それぞれの検体に対してWhole Exome Sequence（①遺伝子変異解析、②Spectrum解析、③コピー数解析）、RNA sequence（①遺伝子発現解析、②fusion geneの解析）、プロテオーム解析、代謝産物の測定によるメタボローム解析による数理学的統合解析を行った。その結果、440種類の免疫関連細胞関連分子の胆管癌症例における発現プロファイルを得た。
具体的にその成果を述べる。予後(再発)に影響を与えるpathwayとして3つの遺伝子セットCytokine-cytokine receptor interaction 9、Natural killer cell mediated cytotoxicity、Chemokine signaling pathway以上の活性化を認めた。また。Cytolytic activityを示す分子は再発に比べて非再発例において過剰発現していた。具体的にはPRF1 (p value q value)は(0.040, 0.09)有意に高発現しており、GZMB(0.0164205,0.045782), IFNG(0.0165776, 0.045967)も同様であったが、GZMAは有意差を認めていない。しかし、新たな治療標的となる新規、免疫関連分子を同定してはいない。現在single cellデータのdeconvolutionを行っており、どの細胞由来の発現かも合わせて明らかにして投稿する。
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[Journal Article] Fanconi Anemia Complementation Group E, a DNA Repair-Related Gene, Is a Potential Marker of Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma.2022
Author(s)
Takahashi J, Masuda T, Kitagawa A, Tobo T, Nakano Y, Abe T, Ando Y, Kosai K, Kobayashi Y, Matsumoto Y, Yoshizumi T, Mori M, Mimori K. Fanconi Anemia Complementation Group E, a DNA Repair-Related Gene, Is a Potential Marker of Poor Prognosis in Hepatocellular Carcinoma.
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Journal Title
Oncology.
Volume: 100(2)
Pages: 101-113
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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