2019 Fiscal Year Research-status Report
出生三世代コホートによる常位胎盤早期剥離の遺伝・環境要因の究明
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19K09771
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Research Institution | Tohoku University |
Principal Investigator |
倉片 三千代 東北大学, 大学病院, 助教 (10722580)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菅原 準一 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (60280880)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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Keywords | 常位胎盤早期剥離 / ゲノム / ゲノムワイド関連解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
常位胎盤早期剥離(PA: Placental Abruption)は、全妊娠の0.4-1.0%に発症し、遺伝・環境因子が複雑に関与する多因子疾患であるが、いまだ明確な原因は不明である。喫煙、若年・高齢妊娠、妊娠高血圧腎症(PE:Preeclampsia)合併、PAの既往などの多くのリスク因子が報告されているが、人種/民族差も大きいことが知られている。我が国においては、本疾患に関連する大規模なゲノムワイド関連解析(GWAS: Genome Wide Association Study) の報告はなく、遺伝的要因の究明が求められている。本研究は、世界的にもユニークな大規模出生三世代コホートの検体・情報(妊婦22,493名の登録)を用い、日本人のゲノム解析に最適化されたジャポニカアレイによる、妊産婦(母)・父・児の複雑な遺伝効果を考慮に入れたゲノムワイド関連解析(EMIM/PREMIM, BMC Bioinformatics 2012) を行う。具体的には、これまで報告された疾患感受性遺伝子変異の日本人PAにおける妥当性の検証を行い、さらに新規のゲノム変異の探索を行う。加えて、これらのゲノム変異情報に、疾患に有意に関連する疫学的要因を加えることで、超高次元疾患発症予測式の構築を目指す。 2019年度は、データクリーニングを進めると共に、PAのPhenotypeの確認・検証を行い、解析対象妊婦(PA 100名、対照200名)トリオ(PA 50組、対照100組)の選択を進めており、並行してDNA抽出とジャポニカアレイ解析を推進中である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現時点まで、コホート参加者の臨床情報から解析対象妊婦(PA 58名、対照200名)の選択が進み、併せて夫婦児トリオの抽出も着手した。SNPアレイ解析はほぼ全例で完了しており、インピュテーションに着手している。
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Strategy for Future Research Activity |
家系情報の整理が複雑なためやや時間を要しているが、前述のようにほぼ順調に進行している。今後は、夫婦児トリオの抽出を完了し、三世代における疫学解析を開始する。
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Causes of Carryover |
前述したように研究計画に沿いほぼ順調に経過し、また、ジャポニカアレイ解析に係る費用が当初より削減できたため。
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