2020 Fiscal Year Research-status Report
出生三世代コホートによる常位胎盤早期剥離の遺伝・環境要因の究明
Project/Area Number |
19K09771
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Research Institution | Tohoku University |
Principal Investigator |
倉片 三千代 東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (10722580)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菅原 準一 東北大学, 医学系研究科, 教授 (60280880)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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Keywords | 常位胎盤早期剥離 / ゲノム / ゲノムワイド関連解析 / SNPアレイ / メタボローム解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
常位胎盤早期剥離(PA: Placental Abruption)は、全妊娠の0.4-1.0%に発症し、遺伝・環境因子が複雑に関与する多因子疾患であるが、いまだ明確な原因は不明である。喫煙、若年・高齢妊娠、妊娠高血圧腎症(PE:Preeclampsia)合併、PAの既往などの多くのリスク因子が報告されているが、人種/民族差も大きいことが知られている。我が国においては、本疾患に関連する大規模なゲノムワイド関連解析(GWAS: Genome Wide Association Study) の報告はなく、遺伝的要因の究明が求められている。本研究は、世界的にもユニークな大規模出生三世代コホートの検体・情報(妊婦22,493名の登録)を用い、日本人のゲノム解析に最適化されたジャポニカアレイによる、妊産婦(母)・父・児の複雑な遺伝効果を考慮に入れたゲノムワイド関連解析(EMIM/PREMIM, BMC Bioinformatics 2012) を行う。具体的には、これまで報告された疾患感受性遺伝子変異の日本人PAにおける妥当性の検証を行い、さらに新規のゲノム変異の探索を行う。加えて、これらのゲノム変異情報に、疾患に有意に関連する血漿メタボローム解析情報、疫学的情報を加えることで、疾患発症予測式の構築を目指す。 2020年度は、データクリーニングを完了、PAのPhenotypeの確認・検証を行い、解析対象妊婦の選択が終了した。対象症例のジャポニカアレイ解析は完了しており、血漿メタボローム解析のため、対象リストの作成を進めている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現時点まで、コホート参加者の臨床情報から解析対象妊婦(PA 100名、対照200名)の選択が進み、併せて夫婦児トリオの抽出も着手した。SNPアレイ解析はほぼ全例で完了している。発症予測式に用いる血漿メタボローム解析を開始するため、検体選択を進めている。
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Strategy for Future Research Activity |
解析対象症例のSNPアレイ解析は完了しており、2020年度は情報整理に専念した。2021年度は、血漿メタボローム解析を進めて、常位胎盤早期はく離罹患と関連する代謝物情報を精精緻に解析する。
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Causes of Carryover |
コロナ感染症の拡大により、研究者の移動制限等もあり行う予定であった情報整理、解析データの確認(個人情報を含むため来学が必要)に遅延を生じた。2021年度は、これらの遅れを解消すべく、繰り越しされた予算を血漿メタボローム解析に充当することで、中心的に推進することとした。
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