2021 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム・エピゲノム・トランスクリプトーム解析による頭頸部癌の腫瘍内不均一性の解明
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19K09923
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小林 謙也 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (80648311)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 泰昌 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (00296708)
吉本 世一 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (00462242)
安藤 瑞生 岡山大学, 岡山大学, 教授 (60511467)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 腫瘍内不均一性 / TP53 / 頭頸部扁平上皮癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は予後不良頭頸部扁平上皮癌の時間的・空間的な腫瘍内不均一性を解明することを目的としている。標準治療367例から抽出した局所頸部再発症63例の初回腫瘍及び再発腫瘍126検体のTP53、PIK3CA、AKT、HRASの変異ステータスを次世代シークエンサーにて時系列に解析した。TP53に関しては、フルカバレッジのディープシーケンスを施行した。
再発した腫瘍のうち、22%でTP53に新たな変異が蓄積し、16%が元の変異を失っていた。TP53変異の蓄積は、口腔癌では咽頭癌や喉頭癌に比べて有意に高かった（33％vs7％、p = 0.016）。PIK3AC、AKT、HRASは全例で初回変異を失っていた。
再発後の2年間の生存率は、再発時のTP53ステータスと関連していたが、初期腫瘍のTP53ステータスとは関連していなかった。再発腫瘍のTP53ステータスは、多変量解析において独立した危険因子であった（ハザード比、5.76；95％CI、1.86-17.8；p＝0.0023）。
以上より、再発頭頚部扁平上皮癌の約3分の1は、初期腫瘍と異なるTP53ステータスであった。変異の蓄積は、原発部位によって異なっていた。再発腫瘍のTP53ステータスを詳細に解析することで、再発後の予後予測に有用であった。
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[Journal Article] Olfactory preservation in craniofacial resection of tumor invading hemianterior skull base: operative video.2021
Author(s)
Kobayashi K, Miyakita Y, Matsumoto F, Omura G, Matsumura S, Ikeda A, Eguchi K, Ito A, Narita Y, Akazawa S, Yoshimoto S.
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Journal Title
J Neurol Surg B.
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed
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[Journal Article] Full-coverage TP53 deep sequencing of recurrent head and neck squamous cell carcinoma facilitates prognostic assessment after recurrence.2021
Author(s)
Kobayashi K, Yoshimoto S, Ando M, Matsumoto F, Murakami N, Omura G, Honma Y, Matsumoto Y, Ikeda A, Sakai A, Eguchi K, Ito A, Ryo E, Yatabe Y, Mori T.
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Journal Title
Oral Oncol.
Volume: 113
Pages: 105091
Peer Reviewed
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[Journal Article] Uniform infection screening allowed safe head and neck surgery during the coronavirus disease 2019 pandemic in Japan.2021
Author(s)
Ito A, Kobayashi K, Shiotsuka M, Sato T, Omura G, Matsumoto Y, Ikeda A, Sakai A, Eguchi K, Takano T, Matsumoto F, Kobayashi O, Iwata S, Yoshimoto S.
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Journal Title
Jpn J Clin Oncol.
Volume: 51
Pages: 400-407
Peer Reviewed
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