2020 Fiscal Year Research-status Report
トランスオミックス解析によるぶどう膜炎の新規バイオマーカーの確立と治療法の開発
Project/Area Number |
19K09959
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Research Institution | Tokyo Medical University |
Principal Investigator |
臼井 嘉彦 東京医科大学, 医学部, 准教授 (50408142)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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Keywords | ぶどう膜炎 / オミックス解析 / マイクロRNA |
Outline of Annual Research Achievements |
ぶどう膜炎患者を対象に末梢血をサンプルとし、高感度DNAチップを用いてマイクロRNAの網羅的発現解析を実施し、バイオインフォマティックスによりその標的遺伝子を探索した。さらにマイクロRNAの複合的メカニズムや相互関係を検討し、新規バイオマーカーの創出を試みた。東京医大病院眼科を受診した治療の既往がないベーチェット病患者10例、サルコイドーシス患者18例、VKH患者17例を対象とし、血清からRNAの抽出を行った。次いでマイクロアレイを用いて2,565種類のマイクロRNA発現レベルを網羅的に解析した。対照として11例の健常者および白内障患者を用い、各非感染性ぶどう膜炎において変動するマイクロRNAを探索した。その結果、ベーチェット病患者では281種類のマイクロRNAの発現増加と137種類のマイクロRNAの発現低下がみられ、サルコイドーシス患者では35種類のマイクロRNAの発現増加と86種類のマイクロRNAの発現低下、VKH患者では153種類のマイクロRNAの発現増加と35種類のマイクロRNAの発現低下がそれぞれ確認された。いずれのぶどう膜炎でも18種類のマイクロRNAの発現増加と27種類の発現低下が共通して認められた。一方、血清マイクロRNAの網羅的解析からクラスター解析を行った結果、ベーチェット病、サルコイドーシス、VKHにおけるマイクロRNAの発現パターンが異なることがわかった。さらに主成分分析においても、クラスター解析と同様にベーチェット病、VKH、サルコイドーシスが血清マイクロRNAのプロファイルにより集団群が分かれた。以上の結果より、サイトカインを代表とする免疫液性因子以外にも炎症病態を修飾するマイクロRNAのプロファイルが各ぶどう膜炎で異なっていることが示された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
オミックス解析の中でもマイクロRNAとメタボローム解析の両方とも論文がアクセプトされたため。
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Strategy for Future Research Activity |
オミックス解析の中でも、プロテオミクス解析による検討を現在行っている。また、マイクロRNAとメタボローム解析においても症例数を増加させさらに検討を行っている。最終的には統合オミックス解析を行うことで、さらなるバイオマーカ創出を試みていく。
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Causes of Carryover |
8837円余りが生じてしまった。残りは次年度に使用する予定である。
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Research Products
(24 results)
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[Journal Article] Programmed Cell Death-1 Pathway Deficiency Enhances Autoimmunity Leading to Dacryoadenitis of Mice.2021
Author(s)
Sakurai Y, Usui Y, Hattori T, Takeuchi M, Takayama K, Karasawa Y, Nishio Y, Yamakawa N, Saitoh D, Goto H, Ito M.
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Journal Title
Am J Pathol
Volume: in press
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Share Differential Tissue Metabolic Signatures in IgG4-Related Ophthalmic Disease and Orbital Mucosa-Associated Lymphoid Tissue Lymphoma.2021
Author(s)
Shimizu H, Usui Y, Wakita R, Aita Y, Tomita A, Tsubota K, Asakage M, Nezu N, Komatsu H, Umazume K, Sugimoto M, Goto H.
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Journal Title
Invest Ophthalmol Vis Sci
Volume: in press
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Comprehensive Gene Analysis of IgG4-Related Ophthalmic Disease Using RNA Sequencing2021
Author(s)
Asakage M, Usui Y, Nezu N, Shimizu H, Tsubota K, Umazume K, Yamakawa N, Umezu T, Suwanai H, Kuroda M, Goto H.
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Journal Title
Invest Ophthalmol Vis Sci
Volume: in press
Pages: in press
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Vitreous metabolomics profiling of proliferative diabetic retinopathy2021
Author(s)
Tomita Y, Cagnone G, Fu Z, Cakir B, Kotoda Y, Asakage M, Wakabayashi Y, Hellström A, Joyal JS, Talukdar S, Smith LEH, Usui Y.
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Journal Title
Diabetologia
Volume: 64
Pages: 70-82
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] High-Throughput MicroRNA Profiling of Vitreoretinal Lymphoma: Vitreous and Serum MicroRNA Profiles Distinct from Uveitis2020
Author(s)
Minezaki T, Usui Y, Asakage M, Takanashi M, Shimizu H, Nezu N, Narimatsu A, Tsubota K, Umazume K, Yamakawa N, Kuroda M, Goto H.
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Journal Title
J Clin Med
Volume: 9
Pages: 1844
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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