2022 Fiscal Year Final Research Report

Oral Cancer Precision Therapy Based on Integrated Multi-Omics Analysis of Gargle Samples

Research Project

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Project/Area Number	19K10362
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Allocation Type	Multi-year Fund
Section	一般
Review Section	Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
Research Institution	Social medical corporation Hakuaikai (Clinical Research Center) (2020-2022) Kagoshima University (2019)
Principal Investigator	HAMADA Tomofumi 社会医療法人博愛会(臨床研究センター), 歯科口腔外科, 部長 (00444894)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	谷本昭英鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151) 横山勢也鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941) 杉浦剛鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 教授 (40322292) 中村利明鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 講師 (60381183) 山田宗茂京都大学, 医学研究科, 特定研究員 (60625242) 中村康大鹿児島大学, 鹿児島大学病院, 医員 (90783506)
Project Period (FY)	2019-04-01 – 2023-03-31
Keywords	エピジェネティクス / DNAメチル化 / 口腔癌 / うがい液 / リキッドバイオプシー / シェーグレン症候群
Outline of Final Research Achievements	The purpose of this study was to establish an integrated genetic information database for oral cancer and normal mucosa, and then to realize individualized prescribing treatment of oral cancer based on the genetic information. First, we collected gargle fluid from approximately 1000 healthy oral healthy subjects and reported epigenomic profiling of healthy Japanese. Next, we analyzed gargle fluid from patients with oral cancer, its precancerous lesions, and inflammatory diseases of the oral cavity, and identified (1) a group of abnormal DNA methylation genes that can differentiate oral cancer cases from a group of suspected oral cancer cases including inflammatory diseases and oral precancerous lesions and (2) a group of microRNAs that are specifically expressed in Sjogren's syndrome. The results were reported in a paper and intellectual property was obtained as a new diagnostic method that can cover the shortcomings of existing diagnostic methods.
Free Research Field	口腔外科学
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	近年がん治療においてプレシジョン治療の概念が急速に普及している。その中核は、常に変化する腫瘍の性状をリアルタイムに把握する体液を用いたリキッドバイオプシーである。口腔癌においても液体生検による最適化治療の確立は急務であるが、有用なマーカーは見出されておらず、その基盤となる統合的遺伝情報データベースも存在しない。このような背景のなか、本研究は健常日本人の大規模なエピゲノムプロファイリングを初めて報告し、今後の口腔癌研究の基礎となるデータベースの構築に寄与した。また新規バイオマーカーを同定し、既存の診断法の欠点をカバーし得る新規診断法を構築したことで、今後の臨床応用が期待される。