2019 Fiscal Year Research-status Report
統合的オミックス解析による希少遺伝性疾患における歯数を規定する分子機構の解明
| Project/Area Number |
19K10376
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
|---|
Principal Investigator |
小川 卓也 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授 (50401360)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 敏博 東京医科歯科大学, 統合研究機構, 教授 (50292850)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
| Keywords | 多数歯欠損症 / 鎖骨頭蓋異形成症 / 希少遺伝性疾患 / 統合的オミックス解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
顎顔面先天異常を伴う希少遺伝性疾患患者における歯の異常に関して、同一の遺伝子変異を有するものでもその表現型が異なることが多く、一次的なゲノムデータ解析によるゲノム配列情報だけでは、形質情報との因果関係を明らかにするのは極めて困難を要する。次の段階として、形質情報に影響を及ぼす因子としてゲノム配列異常を修飾する遺伝子や遺伝子変異に伴う形質情報に影響を及ぼすバイオマーカーを同定することが求められている。本課題では、歯の数ならびに形態異常を有する希少遺伝性疾患患者から得られる大規模ヒト疾患ゲノムデータを、生物学・臨床情報と分野横断的に統合することで、従来型のゲノム配列解析では困難であった遺伝情報と形質情報の関連性を遺伝統計学的観点から明らかにし、歯の数ならびに形態を規定する分子機構を統合的オミックス解析により解明することを目的とした。2019年度の研究実績の概要を以下に示す。
①先天性欠如歯：6歯以上の先天性多数歯欠損症患者39名のゲノムDNAを取得した。また、山梨県甲州市の一般集団を対象にした縦断調査により、母親の妊娠中の喫煙習慣と、その子どもの永久歯の欠損の発症との関連性を明らかにすることができた。
②過剰歯：鎖骨頭蓋異形成症の家系において、罹患患者2名の過剰埋伏歯から得られた歯由来細胞の初代培養を行った。
③歯根形態異常：歯根長の異常を伴うoculofaciocardiodental (OFCD) 症候群患者ならびに歯根長に異常を認めない患者の矯正歯科治療にために便宜抜歯された下顎小臼歯から得られた歯根膜細胞よりRNAを抽出し、マイクロアレイにより遺伝子発現の差を検討した。遺伝子オントロジー解析により歯根形成に関わる転写因子、ならびにパスウェイ解析により歯の形成に関わるパスウェイを抽出することができた。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
希少遺伝性疾患である先天性多数歯欠損症、鎖骨頭蓋異形成症ならびにOFCD症候群患者から臨床情報、ゲノムDNAだけではなく、疾患罹患組織を採取し、解析を行っている。
|
| Strategy for Future Research Activity |
先天性多数歯欠損症の家系においてエクソーム解析を行い、候補遺伝子を絞り込む。鎖骨頭蓋異形成症家系より得られた歯由来細胞からRNAを抽出し、マイクロアレイを行う。さらに、OFCD症候群患者から得られた情報を基に、責任遺伝子BCORの下流遺伝子の絞り込みを行う。
|
| Causes of Carryover |
2019年度は、先天性多数歯欠損症においてはゲノムDNAの蓄積に費やしたため。来年度はエクソーム解析に使用する。
|
