2019 Fiscal Year Research-status Report
Elucidating expression status of mental illness-related genes, based on single cell analysis of human-postmortem samples
| Project/Area Number |
19K10678
|
|---|
| Research Institution | Gunma University |
|---|
Principal Investigator |
高橋 遥一郎 群馬大学, 大学院医学系研究科, 講師 (50640538)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小湊 慶彦 群馬大学, 大学院医学系研究科, 教授 (30205512)
窪 理英子 群馬大学, 医学部, 技術職員 (40747127)
早川 輝 群馬大学, 大学院医学系研究科, 助教 (90758575)
佐野 利恵 群馬大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (70455955)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
| Keywords | 精神疾患 / 統合失調症 / 死後脳 / シングルセル |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
1．ヒト死後脳から、単一細胞における統合失調症発症リスク遺伝子の発現を一分子レベルで定量的に解析する手法を完成させた。具体的には、ヒト死後脳に対してsingle molecule fluorescent in situ hybridizationを行い、その蛍光シグナルを新規に開発したコンピュータープログラムを用いて、再現性を持って解析できるようにした。同プログラムの検証と有効性は論文発表されて公開されている他（Nucleic Acids Res. 2020 May 8. pii: gkaa312. doi: 10.1093/nar/gkaa312）、同プログラム自体も一般に公開され使用できるようになっている。またその使用方法についてのセミナーもweb上で公開される予定である。
２．上記の手法を用いて、ヒトの死後脳における統合失調症発症リスク遺伝子の発現を定量的に評価した。10代から20代の若年者10名を対象としており、着目した遺伝子はSNX19遺伝子とAS3MT遺伝子である。また、特に統合失調症のリスクと相関するこれら遺伝子の特定のスプライシングバリアント（SNX19-junc8.10およびAS3MTd2d3）に関しても、single molecule in situ hybridization法を用いて半定量的に評価した。現在これらの結果について内容をまとめており、近く論文発表する予定である。
3．これらの得られたデータを基に、培養細胞を用いた実験により、これらの遺伝子の発現調節機構について解明する必要がある。実験手法や培養細胞について予備的なデータを収集中であり、対象とする細胞が選定されつつある。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
既に一報の論文発表を行った他、もう一報についても近日中に発表予定であるため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
１．現在進行中の実験結果についてまとめ、近日中に論文発表する。
２．得られたデータを基に、メチル化及び一塩基多型と遺伝子発現との関係も調査する。そのために用いる培養細胞について予備的なデータを収集中であり、対象とする細胞が選定されつつある。
|
Research Products
(17 results)
