2021 Fiscal Year Final Research Report
Bioimaging and computational approach to elucidate genetic diseases based on phenotypic analysis
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19K12218
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
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| Research Institution | Ehime University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | バイオイメージング / 蛍光イメージング / 光学顕微鏡 / 画像解析 / メダカ / 遺伝統計学 |
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| Outline of Final Research Achievements |
This study aimed to construct measurement and analysis techniques that enable phenotypic comparative analysis between medaka strains, which can image the whole body of individuals, in order to elucidate the genetic background related to diseases. First, we developed a wide-field, high-resolution two-photon excitation light sheet microscope for observing cells throughout the body of juvenile medaka fish. Using this microscope, we proceeded with the measurement and analysis of mutant strains with bone abnormalities, and devised a method for quantifying bone morphology using a local feature descriptor, and developed a method for comparing medaka mutant strains at the individual level.
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| Free Research Field |
バイオイメージング
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
遺伝学的な未解決問題をより基礎的な立場から検証するためにモデル生物を利用した計測・解析の方法論の発展は極めて重要である．メダカの利点は近交系の樹立が可能であることで遺伝学研究において脊椎動物としてユニークなモデルとなる．本研究では近年急速に発展している蛍光計測技術および画像解析技術の応用により定量的な個体解析から遺伝学へ結びつける研究を目的とした。今後これまで捉えられなかった表現型の検出から遺伝背景の理解が可能となると期待される．
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