2022 Fiscal Year Research-status Report
ゲノム変異から探る ～ カロリー制限の放射線発がん予防機構の解明
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19K12335
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| Research Institution | National Institutes for Quantum Science and Technology |
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Principal Investigator |
尚 奕 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 放射線医学研究所 放射線影響研究部, 主任研究員 (50533189)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | カロリー制限 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
子ども期の放射線被ばく影響では、生涯の発がんリスクの上昇が最も心配される。我々はマウスを用いて、子ども期の放射線被ばくによる肝癌リスクを、成体期からのカロリー制限により低減できることを報告した。 本研究は組織病理学及び次世代シークエンス解析技術を駆使し、1.肝癌発生における放射線特異的な変異(Radiation signature)の存否を確認する。2.異なるカロリー条件で発症した肝癌の遺伝子変異頻度、パターンの違いを明らかにする。具体的に、B6C3F1雄マウスを用いて、非照射または生後8日齢にX線3.8Gyを全 身照射後、49日齢からカロリー制限を開始し、標準食95kcal/週/匹(非制限)または制限食65kcal/週/匹(約30%のカロリー制限)を摂取させた。終生飼育群は 各60匹、タイムコース群は100日齢ごとに各群マウス3匹ずつ解剖し、肝癌の発症時期を検証するための肝癌と非癌組織のホルマリン固定と遺伝子変異解析のための凍結保存を完了した。これらのサンプルを病理スクリーニングによって病変の悪性度を確認後、選定した癌と、レファレンスゲノム配列を取るための同個体肝臓非癌部位から、レーザーマイクロダイセクション法で組織を切り出して、ゲノムDNAを精製し、次世代シークエンス法で全エクソーム配列を解読して、遺伝子 変異頻度、パターン等を調べる。令和4年度は前年度に引き続き、癌及び前がん病変サンプルから取得したゲノム配列データを用いて、前年度に確立した変異検出に用いる解析パイプライン、パラメータ設定条件を用いてデータ解析を行い、マウス肝癌組織に生じたドライバー変異を複数検出した。これらの変異出現頻度、被ばく及びカロリー制限との相関性を検討した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
コロナ禍の中で研究材料の不足や使用している病理支援システム及びゲノム解析用サーバーの多発的不具合によって研究進捗がやや遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後はゲノム情報の解析を集中的に行い、変異発生の特徴、順番、ゲノムコピー数異常等解析項目を完了させる。さらに変異シグネチャ解析を行い、放射線被ばく・カロリー制限がゲノム全体に対する影響を調べて、原著論文に纏める。
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| Causes of Carryover |
前述理由で研究が遅れたため、次年度に使用額が生じた。
次年度はデータ解析を完了させて、論文執筆を行う予定である。主に研究成果を国際学会に発表する費用、論文校閲、投稿掲載料
に使用する計画である。
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