2022 Fiscal Year Research-status Report
レジオネラ属菌感染リスク評価のためのアメーバ内動態と菌種間相互作用に関する研究
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19K12376
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| Research Institution | Kobe Institute of Health |
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Principal Investigator |
中西 典子 神戸市健康科学研究所, 感染症部, 副部長 (50615490)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
野本 竜平 神戸市健康科学研究所, その他部局等, 副部長 (60642238)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | レジオネラ属菌 / アメーバ / 全ゲノム解析 / RNA-Seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、アメーバ内のレジオネラ属菌種間の相互作用に着目し、アメーバ内での動態およびゲノムワイドな多株比較解析からレジオネラ属菌種間のゲノム上
の可動性遺伝領域の構造及び組換えの実態を明らかにし、さらにオミクス解析によるアメーバ内のレジオネラ属菌の挙動を分子レベルで明らかにする。
本年度は、レジオネラ症が発生した施設について、施設環境調査でL.pneumophilaSG1,SG2,SG3,SG6,SG10, L.maceachernii,L.londiniensisが分離された。また、宿主アメーバとして、Hartmannella.sppとVermamoeba vermiformisを検出したことから、これらの宿主アメーバに寄生することで施設の消毒を逃れていた可能性が考えられた。さらに、同一患者から分離された株をすべてゲノム解析したところ、SNVは0～41個の範囲で多様性があり、同時に複数の遺伝系統に暴露されたことが示唆された。
2018年、2019年に種々の環境から分離して室温放置していた無栄養寒天培地からAcanthamoeba、Hartmannella、Naegleriaが発育してくることを確認したが、液体培地での増殖には至っていないので、無菌化条件や様々な液体培地を検討する必要がある。また、種々の環境からL. pneumophilaとともに分離されたレジオネラ属菌の代表株である浴槽室由来のL. londiniensis、L. israelensis、L. micdadei、L. cherrii、L. rubrilucens、冷却塔由来のL. rubrilucens、L. anisa、土壌由来のL. longbeachaeについてNanoporeを用いて完全長配列の決定を進めた。
今後、宿主アメーバ標準株および種々の環境から分離したアメーバ内でのレジオネラ属菌の挙動を把握するためにオミクス解析を実施する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
新型コロナウイルス感染症の流行に伴い、対応が必要な業務量が増加し、当所予定していた本研究のエフォートが確保できなかった。ゲノム解析は進めたものの、実験も引き続き検討が必要であるため、遅れていると判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在までの計画の遅れを取り戻すために、下記の項目について集中的に実施する予定である。
種々の環境から分離したアメーバの液体培養を行う。アメーバ内でのレジオネラ属菌の挙動を把握するためにオミクス解析を実施する。さらに、アメーバ内におけるレジオネラ属菌異種間相互作用について、多株比較ゲノム解析からゲノム上の可動性遺伝領域（MGEs）の構造比較や組換えによるゲノムのモザイク化についても解析し、レジオネラゲノム上の組換えに関するホットスポットを明らかにする予定である。
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| Causes of Carryover |
新型コロナ感染症の検査対応のため業務負担が増加し、予定していた解析が実施できなかった。RNA-seqの試薬や比較ゲノムのための予定ゲノム解析対象株を増やし、次世代シーケンサー解析を含めた核酸配列解析用試薬として使用し、引き続き適切に予算を執行していく予定である。
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[Presentation] Bacterial counts by flow cytometry can determine presence/absence of Legionella in bath water.2022
Author(s)
Taguri, T., Cai, G., Nakanishi, N., Hiratsuka, T., Inoue, H., Shimoda, T., Shinmichi K., Kura F. and Amemura-Maekawa, J
Organizer
The 10th International Conference on Legionella.
Int'l Joint Research
