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2021 Fiscal Year Research-status Report

Cell observation platform using biological nanopore probes

Research Project

Project/Area Number 19K15418
Research InstitutionNagaoka University of Technology

Principal Investigator

庄司 観  長岡技術科学大学, 産学融合トップランナー養成センター, 特任講師 (80788258)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Keywords走査型イオンコンダクタンス顕微鏡 / ナノポアセンシング / 生体ナノポア / 脂質二分子膜 / ハイドロゲル / ナノピペット
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ポア形成膜タンパク質をプローブ先端に再構築した生体ナノポアプローブとマイクロ流路を組み合わせた、新たな細胞観察プラットフォームの開発を最終的な目標としている。生体ナノポプローブを用いた細胞観察手法を確立することにより、細胞から放出される分泌物質の局所センシングが可能となり、細胞生物学、創薬、再生医療工学などの分野において、新たな細胞観察手法を提案することが可能となる。本年度は、プローブの位置制御システムを構築し、昨年度までに開発したゲル封入ナノピペットを用いた生体ナノポアプローブの局所分子検出性能の評価および走査型イオンコンダクタンス顕微鏡(SICM)プローブとしての性能評価を実施した。
1.局所分子検出性能の評価
ゲル封入ナノピペットを用いた生体ナノポアプローブを自作のSICMシステムに搭載し、分子拡散の様子を計測することで本プローブ局所分子検出性能を評価した。分子検出実験を行った結果、シミュレーションと似た傾向の拡散の様子を計測することに成功し、本プローブの有用性を示すことができた。一方、計測された濃度に関しては約0.1μM程度の誤差があった。今後は、プローブによる分子検出の有効範囲を有限要素シミュレーションで確認し、本プローブの空間分解能について検討する。
2.SICMプローブとしての性能評価
生体ナノポアプローブを用いたプローブ顕微鏡は、原理的には分子検出および表面形状を同時に計測することが可能であるが、生体ナノポアプローブを用いた表面形状測定に関する知見は少ない。本実験では、直径約10nmの生体ナノポアを形成した生体ナノポアプローブを作製し、SICMプローブとしての有用性を評価した。その結果、生体ナノポアを用いることで従来のガラスナノピペットを用いたSICMよりも高空間分解能化が可能であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本年度は、生体ナノポアプローブの局所分子検出性能および表面形状計測性能に関して評価した。その結果、分子検出性能評価においては分子濃度のマッピングに成功し、さらに、表面形状計測性能評価においては従来の走査型イオンコンダクタンス顕微鏡よりも高空間分解能化が可能であることが示唆された。以上の結果は、本申請研究で目指す生体ナノポアプローブを用いた細胞計測システムの有用性を裏付ける結果であり、当初の予定よりもいい進捗状況となっている。

Strategy for Future Research Activity

来年度は、これまでに開発したシステムを用いて実際に細胞計測を実施する。また、細胞計測結果をもとに、本システムの有効性・改善点について検討し、生体ナノポアプローブを用いた細胞観察プラットフォームを確立する。

  • Research Products

    (19 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Microcavity volume control on a tip of Ag/AgCl electrodes for stable channel current measurements of biological nanopores2022

    • Author(s)
      Hasegawa Naru、Shoji Kan
    • Journal Title

      The Analyst

      Volume: 147 Pages: 1191~1198

    • DOI

      10.1039/D2AN00014H

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Development of molecule-gated DNA nanopore for biomolecular measurement2022

    • Author(s)
      Hiromu Akai, Kan Shoji
    • Organizer
      International Workshop on Molecular Cybernetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Microfluidic channels for aligning multi-compartment liposomes2022

    • Author(s)
      Shun Okada, Kan Shoji
    • Organizer
      International Workshop on Molecular Cybernetics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Artificial Cell Membrane Systems Leading to a Cell-Machine Interface2021

    • Author(s)
      Kan Shoji
    • Organizer
      32nd 2021 International Symposium on Micro-Nano Mechatronics and Human Science
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生物-機械インターフェイスの構築を目指したプローブ型人工細胞膜システムの開発2021

    • Author(s)
      庄司観
    • Organizer
      第7回分子サイバネティクス領域セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 人工細胞膜システムの応用展開 ~生物と機械のインターフェイス構築を目指して~2021

    • Author(s)
      庄司観
    • Organizer
      日本機械学会 バイオエンジニアリング部門 出藍セミナーシリーズ 第2回
    • Invited
  • [Presentation] 工細胞膜を用いたセンサシステム2021

    • Author(s)
      庄司観
    • Organizer
      第62回生体・医療材料部門員会
    • Invited
  • [Presentation] Biological Nanopore Probe for SICM Applications2021

    • Author(s)
      Ryo Yoshihara, Kan Shoji
    • Organizer
      The 25th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA Nanopore-Threaded Gold Nanoneedles for Channel Current Recording2021

    • Author(s)
      Shogo Ikarashi, Hiromu Akai, Hiroki Koiwa, Kan Shoji
    • Organizer
      6th-STI-Gigaku 2021
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNAナノポア修飾ニードルによるポアの膜挿入効率の改善2021

    • Author(s)
      五十嵐正悟,赤井大夢,小岩滉宜,庄司観
    • Organizer
      Cheminas44
  • [Presentation] ガラスマイクロキャピラリ流路のためのコネクタ開発2021

    • Author(s)
      岡田瞬,庄司観
    • Organizer
      Cheminas44
  • [Presentation] 光硬化ゲル充填生体ナノポアプローブの開発2021

    • Author(s)
      能美柊汰,吉原諒,庄司観
    • Organizer
      Cheminas44
  • [Presentation] マイクロ流路と生体ナノポアプローブを組み合わせたセンサシステム2021

    • Author(s)
      庄司観
    • Organizer
      Cheminas44
  • [Presentation] 生体分子計測を目指した分子応答性 DNA ナノポアの提案2021

    • Author(s)
      赤井大夢,五十嵐正悟,庄司観
    • Organizer
      第5回分子ロボティクス年次大会
  • [Presentation] ギャップジャンクション様システムの構築を目指した DNA ナノチャネルの開発2021

    • Author(s)
      小岩滉宜,五十嵐正悟,庄司観
    • Organizer
      第5回分子ロボティクス年次大会
  • [Presentation] 電流フィードバックによる人工細胞膜形成システムの開発2021

    • Author(s)
      Vu Xuan Viet,吉原諒,庄司観
    • Organizer
      第5回分子ロボティクス年次大会
  • [Presentation] ゲル充填ガラスピペットを用いた生体ナノポアプローブの開発2021

    • Author(s)
      吉原諒,庄司観
    • Organizer
      Cheminas 43
  • [Presentation] チャネル電流計測における溶液体積の影響と制御2021

    • Author(s)
      長谷川就,庄司観
    • Organizer
      Cheminas 43
  • [Book] De-Insertion Current Analysis of Pore-Forming Peptides and Proteins Using Gold Electrode-Supported Lipid Bilayer2021

    • Author(s)
      Kan Shoji (Ediotr: Charles G. Cranfield)
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      Springer Nature

URL: 

Published: 2022-12-28  

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