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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Method for efficient synthesis of chemically functionalization proteins and application for biology research

Research Project

Project/Area Number 19K15705
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

大石 俊輔  名古屋大学, トランスフォーマティブ生命分子研究所, 特任助教 (80707795)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Keywordsタンパク質化学 / ペプチド化学 / ケミカルバイオロジー / 有機合成化学
Outline of Annual Research Achievements

化学合成タンパク質のLate-Stage Functionalization法を開発し、構造が均一な様々な修飾タンパク質を系統的、網羅的に合成することを目的とした。タンパク質を化学的に全合成し、側鎖官能基の反応性を制御することで完全に均一な構造の修飾タンパク質を得ることが 本研究の特徴である。また、このときフォールディング後の活性タンパク質に対し修飾を行い修飾の前後でタンパク質の立体構造を保持し、修飾後に複雑な精製操作無しで生物学実験に適応できる手法の開発を目指した。
特に本研究では生物学的手法では合成が困難なシステインリッチタンパク質(CRP)を標的としている。CRPは抗菌作用、神経毒性、脂質輸送、植物ホルモンなど様々な機能を持つタンパク質ファミリーであ本研究計画では化学合成手法の開発のみにとどまらず、生命科学研究者との共同研究により生命科学研究への展開を目指す。
研究期間全体を通じて、植物表皮パターン形成因子(EPF)の化学合成法の開発とタンパク質の機能解析のための修飾タンパク質の効率合成法の開発に取り組んだ。活性型のEPFタンパク質を得たあと、部位特異的な反応によって化学修飾を行う方法であり、さまざまなEPF誘導体を迅速に得ることが可能である。これにより、個別のバイオイメージング実験に適した蛍光色素の種類などの探索に有用である。
最終年度には、論文発表に向けた補足的な実験データの取得やデータの整理、原稿の執筆を行い、国際学術誌での成果発表を行った。

  • Research Products

    (5 results)

All 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] ETH Zurich(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      ETH Zurich
  • [Int'l Joint Research] The University of Texas at Austin(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      The University of Texas at Austin
  • [Journal Article] Chemical synthesis of Torenia plant pollen tube attractant proteins by KAHA ligation2022

    • Author(s)
      Kumarswamyreddy Nandarapu、Reddy Damodara N.、Robkis D. Miklos、Kamiya Nao、Tsukamoto Ryoko、Kanaoka Masahiro M.、Higashiyama Tetsuya、Oishi Shunsuke、Bode Jeffrey W.
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 3 Pages: 721~727

    • DOI

      10.1039/d2cb00039c

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chemical synthesis of the EPF-family of plant cysteine-rich proteins and late-stage dye attachment by chemoselective amide-forming ligations2022

    • Author(s)
      Kumarswamyreddy Nandarapu、Nakagawa Ayami、Endo Hitoshi、Shimotohno Akie、Torii Keiko U.、Bode Jeffrey W.、Oishi Shunsuke
    • Journal Title

      RSC Chemical Biology

      Volume: 3 Pages: 1422~1431

    • DOI

      10.1039/d2cb00155a

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Regulation of ammonium acquisition and use in Oryza longistaminata ramets under nitrogen source heterogeneity2022

    • Author(s)
      Kawai Misato、Tabata Ryo、Ohashi Miwa、Honda Haruno、Kamiya Takehiro、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Oishi Shunsuke、Okamoto Satoru、Hachiya Takushi、Sakakibara Hitoshi
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 188 Pages: 2364~2376

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac025

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2023-12-25  

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