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2020 Fiscal Year Research-status Report

ヒト型糖鎖生合成酵素と相同性を有する昆虫由来酵素群の構造機能相関解明と応用展開

Research Project

Project/Area Number 19K15748
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

宮崎 剛亜  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 助教 (30775721)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
KeywordsN結合型糖鎖 / O結合型糖鎖 / 糖転移酵素 / 糖質加水分解酵素 / カイコ / 糖タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、ヒトの糖タンパク質糖鎖の生合成および生分解に関わる糖転移酵素および加水分解酵素と相同性を有するカイコ由来酵素とその他の糖質関連酵素の構造機能解析を行った。
1. カイコ由来GnTIVオルソログは、前年度までにクローニングした配列が不完全であったため、ヒトGnTIVのC末端側領域に相当する部分の塩基配列を同定し、それを含む全長のcDNAをクローニングした。また、種々の可溶性タンパク質タグとの融合タンパク質としての発現を検討した結果、昆虫培養細胞およびカイコ虫体での発現と精製に成功した。
2. カイコ由来α-L-フコシダーゼを大腸菌宿主発現系にて調製し、精製酵素を用いて網羅的に基質特異性の解析を行った。種々のフコース含有オリゴ糖のみならず、ピリジルアミノ化によって標識をしたコアフコース糖鎖や、α-1,3またはα-1,6-コアフコース糖鎖を含む糖タンパク質に対し、フコースを遊離する活性を示した。無脊椎動物由来のα-L-フコシダーゼの糖タンパク質糖鎖に対する活性を調べた例は過去になく、本成果は、国際学術誌Insect Biochem. Mol. Biol.に論文として発表した。
3. 近年、腸内細菌から同定された糖質加水分解酵素ファミリー31(GH31)に属するα-N-アセチルガラクトサミニダーゼのホモログをカイコなどの鱗翅目昆虫は水平伝播によって獲得している。本研究では、カイコ由来ホモログ(BmNag31)が糖タンパク質のO型糖鎖を分解する活性を有することを示した。比較として、腸内細菌Enterococcus faecalis由来酵素(EfNag31A)のX線結晶構造解析を行い、触媒ドメインの立体構造をGH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼとして初めて明らかにした。BmNag31およびEfNag31Aの研究成果は、それぞれ国際学術誌Insect Mol. Biol.およびFEBS Lett.に論文として発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画していた糖転移酵素の結晶構造解析には至っていないが、従来の方法では組換え発現が困難であった糖転移酵素の発現と精製をすることができたのは、今後の研究を遂行するための重要な進展である。また、関連する糖質加水分解酵素の機能および立体構造解析が予想以上に進展しており、複数の論文発表に至っている。そのため、総合的に判断して「おおむね順調に進展している」と評価した。

Strategy for Future Research Activity

課題として残っているのが、複数の糖転移酵素の立体構造の解明である。本年度において確立した組換え発現系を用いて酵素を大量に調製し、結晶化と構造解析に取り組む。また、独立したドメインと予想される領域のみを発現させ、糖結合能の解析や立体構造解析を行うことを計画しており、結果がまとまり次第、論文として発表する予定である。

Causes of Carryover

コロナ禍によって出張の予定がキャンセルされ、旅費での使用が不可能になったため、研究計画を一部前倒しにして消耗品を購入した。繰越額は2021年度分と合わせて実験を遂行するのに必要な消耗品に充てる予定である。

  • Research Products

    (18 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Vienna(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      University of Vienna
  • [Int'l Joint Research] UCT, Prague(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      UCT, Prague
  • [Journal Article] Biochemical characterization of Bombyx mori α-N-acetylgalactosaminidase belonging to the glycoside hydrolase family 312021

    • Author(s)
      Marina Ikegaya, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      Insect Molecular Biology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/imb.12701

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure-function analysis of silkworm sucrose hydrolase uncovers the mechanism of substrate specificity in GH13 subfamily 17 exo-α-glucosidases2020

    • Author(s)
      Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Pages: 8784-8797

    • DOI

      10.1074/jbc.RA120.013595

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of the Enterococcus faecalis α-N-acetylgalactosaminidase, a member of the glycoside hydrolase family 312020

    • Author(s)
      Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 594 Pages: 2282-2293

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13804

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] カイコの糖鎖生物学と糖鎖工学-カイコの糖鎖構造改変と複合型糖鎖生合成酵素の解析2020

    • Author(s)
      宮崎 剛亜
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 58 Pages: 330-332

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] α-L-Fucosidase from Bombyx mori has broad substrate specificity and hydrolyzes core fucosylated N-glycans2020

    • Author(s)
      Shuntaro Nakamura, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      Volume: 124 Pages: 103427

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2020.103427

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural insight into the substrate specificity of Bombyx mori β-fructofuranosidase belonging to the glycoside hydrolase family 322020

    • Author(s)
      Takatsugu Miyazaki, Nozomi Oba, Enoch Y. Park
    • Journal Title

      Insect Biochemistry and Molecular Biology

      Volume: 127 Pages: 103494

    • DOI

      10.1016/j.ibmb.2020.103494

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] α-L-Fucosidase from Bombyx mori has wide substrate specificity and hydrolyzes core-fucosylated N-glycans2021

    • Author(s)
      Shuntaro Nakamura, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Organizer
      The 7th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University (ISFAR-SU2021)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of a glycoside hydrolase family 31 enzyme from Bombyx mori obtained via horizontal gene transfer2021

    • Author(s)
      Marina Ikegaya, Takatsugu Miyazaki, Enoch Y. Park
    • Organizer
      The 7th International Symposium toward the Future of Advanced Researches in Shizuoka University (ISFAR-SU2021)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 糖質加水分解酵素ファミリー65に属するα-1,2-グルコシダーゼの基質認識機構の解明2021

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      2020年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] カイコ由来 GH32 β-フルクトフラノシダーゼ BmSUC1の立体構造解析2021

    • Author(s)
      宮崎 剛亜, 大場 望美, 朴 龍洙
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] Flavobacterium johnsoniae由来α-1,2-グルコシダーゼの立体構造解析2021

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 中井 博之, 朴 龍洙, 宮崎 剛亜
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] Enterococcus faecalis 由来GH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの構造機能解析2020

    • Author(s)
      宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
  • [Presentation] 水平伝播によって獲得したカイコ由来GH31 α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの発現と機能の解析2020

    • Author(s)
      池谷 真里奈, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
  • [Presentation] Flavobacterium johnsoniae由来新奇α-1,2-グルコシダーゼの性質解析2020

    • Author(s)
      中村 駿太郎, 宮崎 剛亜, 朴 龍洙
    • Organizer
      日本応用糖質科学会2020年度大会(第69回)
  • [Remarks] 静岡大学農学部生物工学研究室宮崎グループWeb page

    • URL

      https://wwp.shizuoka.ac.jp/glycoenzyme/

  • [Remarks] 静岡大学農学部生物工学研究室Web page

    • URL

      http://www.agr.shizuoka.ac.jp/c/biotech/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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