2021 Fiscal Year Final Research Report
Evaluation of a rapid detection method of clarithromycin resistance genes in Mycobacterium avium using the Amplification Refractory Mutation System-Loop-Mediated Isothermal Amplification method
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19K16444
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Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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Basic Section 47060:Clinical pharmacy-related
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | クラリスロマイシン / Mycobacterium avium / 薬剤耐性遺伝子 / 23SrRNA / ARMS法 / LAMP法 / 肺MAC症 / 非結核性抗酸菌 |
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| Outline of Final Research Achievements |
Clarithromycin resistance, a key drug in the treatment of Mycobacterium avium diseases, has been reported to be caused by point mutations in 23SrRNA. In this study, we adapted a rapid detection method using the ARMS-LAMP to identify a mutation in the 23S rRNA gene in M. avium isolates. Primers for ARMS-LAMP were designed using PrimerExplorerV5 software based on the nucleotide sequence data for 23S rRNA in M. avium strain 104, and ARMS-LAMP was performed using 30 clinical M. avium isolates. As a result, the ARMS-LAMP method has high sensitivity and specificity, and could be determined in a few hours. On the other hand, this discrepancy between ARMS-LAMP and sequence analysis might be due to non-specific binding or the presence of mixtures of drug-susceptible and -resistant subpopulations in various proportions. The developed ARMS-LAMP method was found to have the potential to be a clinically beneficial examination method.
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| Free Research Field |
医療薬学
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
近年の感染症検査は、大型機器を用いて感染症を迅速に診断する技術の研究開発が主流となっている。しかしこれらの大型機器は、初期費用が高額なため、一般病院や開業医院などに普及することは困難である。一方でARMS-LAMP法は、専用の大型機器等の必要がなく、比較的安価に導入しやすい特長がある。また、LAMP法プライマー設計支援ソフトは、無償で提供されており、誰でも比較的容易にプライマー設計が可能である。
ARMS-LAMP法を各種の感染症に対する迅速診断技術に応用し、新たな検査法として臨床に貢献する上で、本研究課題により得られた研究成果が重要な情報となり、学術的・社会的意義は大きいと考える。
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