2020 Fiscal Year Research-status Report
Identifying mechanisms for development of hematological malignancies among A-bomb survivors
Project/Area Number |
19K16574
|
Research Institution | Radiation Effects Research Foundation |
Principal Investigator |
吉田 稚明 公益財団法人放射線影響研究所, 広島臨床研究部, 副主任研究員 (20832926)
|
Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
Keywords | 慢性骨髄性白血病 / ゲノム異常 / ddPCR |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、被爆者に発症した造血器腫瘍に対する分子解析を通じ、放射線起因性造血器腫瘍の発症機構の解明と、またその発症予測に関与するバイオマーカーを同定することである。2019年度に引き続き、2020年度は、慢性骨髄性白血病(CML)に注目し、解析を実施した。CMLは原爆被爆後に明らかに増加が認められており、BCR-ABL1融合遺伝子の存在がその診断に必要である。CMLは現在慢性骨髄増殖性疾患(MPN)に分類されており、MPNの他の病型の一部ではJAK2変異やCSF3R変異が特徴的とされている。 1980年以前に当研究所で診断されたCMLのFFPE標本から抽出したRNAおよびDNAを用いて、droplet digital PCR法を用いて、造血器腫瘍の診断的価値のある異常(BCR-ABL1融合遺伝子、およびJAK2変異、CSF3R変異)を検索した。古いFFPEサンプルではPCR反応阻害が生じ、ddPCR法で異常が検出されない場合がみられた。しかし、あらかじめ作製したPCR ampliconをddPCR法で解析することで、0.001%の感度で異常を評価することができた。この系を用い、多数検体の解析が可能である。このddPCR解析の中で、臨床学的にCMLと診断されている症例の中の一部でBCR-ABL1がみられない症例が存在していることを確認した。この結果は、他のMPN病型がCMLと診断されている可能性を示唆するものである。その診断の確認をしたうえで、ゲノム異常様式の確認および放射線被曝線量を加味することを検討している。 この解析に加えて、2020年度は2019年に発表した報告に関する総説を投稿した。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
COVID-19による活動制限および、消耗品や試薬流通の遅延のため、研究の遂行が遅れている。しかし、多数検体の解析に移れる条件設定が済んだため、2021年度に完遂できる見込みである。
|
Strategy for Future Research Activity |
2020年度に決定したddPCRの条件で、CML以外の白血病症例についてBCR-ABL1および数種の遺伝子変異検索を実施する予定である。合わせて免疫染色を実施し、診断名の確認を行う。各疾患単位ごとに次世代シーケンサーを用いた網羅的ゲノム異常解析を実施する予定としている。この点に関しては、試料の貴重性から研究倫理的検討を十分行ったうえで実施する予定である。具体的には、当研究所の研究協力者のみならず広く被爆者、またその家族に対して研究の目的、意義などを伝える機会を、施設公開や書面などで設ける予定である。
|
Causes of Carryover |
COVID-19による研究遅延にともない、研究試薬などの一部の購入を次年度にまわしている。
|