血流感染症関連大腸菌を対象とした新規パンデミッククローンの探索と全ゲノム解析

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 19K16658
• Research Institution: Kansai University of Health Sciences
• Principal Investigator: 大瀧 博文 関西医療大学, 保健医療学部, 准教授 (00733172)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: Escherichia coli / ST1193 / 薬剤耐性菌

Outline of Annual Research Achievements

2019～2021年度にかけて以下の研究データを得た（昨年度までの実績より引用）。これらのデータ解析をし、国際紙によるデータ公表に向けて作業中である。
2009年～2018年のに収集された血流感染症関連Escherichia coliの424株のうち，O25 E. coliは112株（26.4%），O75 E.coliは22株（5.2%）存在していた。O25 E. coliは112株を認め，そのうち93株がST131，19株がnon-ST13であった。O75 E. coliは22株のうち，13株がST1193，9株がnon-ST1193であった。キノロン耐性因子においては，O25・ST131株でキノロン耐性を示した80株のうち77株が，4箇所の変異を有しており，いずれもgyrAのS83L およびD87N， parCのS80IおよびE84Vであった。O75・ST1193 E. coliにおいてはキノロン耐性を示した13株すべてが3箇所の変異を有しており，いずれもgyrAのS83L， parCのS80IおよびE84Vであった。
また、2022年度は引き続き臨床分離株収集を続けており、ST1193の検出状況の推移をモニタリングしている。これらのデータも追報としての準備をしている。2022年度は追加で432株を収集し、O25b・ST131 E. coliを141株検出、ESBL産生率が49.6％，キノロン系抗菌薬耐性率が97.9％であった。O75・ST1193クローンは30株検出し、ESBL産生率が23.3％，キノロン系抗菌薬耐性率が100％であった。それ以外の株についてはESBL産生率が16.5％，キノロン系抗菌薬耐性率が37.9％であった。引き続き推移を調査し、これらにおいてもより詳細な解析を加えていきたい。