IDH-wildtype gliomaにおける悪性化機構の解明

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K16823
• Research Institution: Akita University
• Principal Investigator: 小野 隆裕 秋田大学, 医学系研究科, 助教 (80620690)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: IDH / 野生型 / 神経膠腫 / 低悪性度 / 細胞密度 / 乱雑性 / 遺伝子変異 / コピー数解析

Outline of Annual Research Achievements

本研究はIDH野生型神経膠腫（GBMwt）を対象に、これの前駆状態たるpre-GBMwtが存在するか、存在するとすればGBMwtとの間にどのような病理学的、分子生物学的差があるのかを示すことが目的である。
本学のデータベースの中から候補となる症例を抽出し、IDH 1/2のdirect sequencingを行い、IDH野生型膠芽腫の前駆状態といえる9例を見出した。これら症例の病理学的所見としてKi67 index、phh3 index、血管症面積（CD31）を算出した。また、細胞密度および腫脹細胞の配列の乱雑性を定量化するプログラムを作成し、解析を行った。これにより病理解析はほぼ終了した。
次いでDNAを抽出し、次世代sequencingによる遺伝子変異の解析とコピー数解析にうつったが、キットによるDNAの抽出量が不安定で、現在、試行中である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

対象症例の病理解析はほぼ終了した。
遺伝子解析についてはDNA抽出方法に問題があり、方法の検討中である。

Strategy for Future Research Activity

DNA抽出の方法が定まれば、研究自体は1年で終了する予定。DNA抽出キットを別の試薬に変更するとともに、遺伝子変異の解析について、当初の計画ではアンプリコン増幅によるパネルシークエンスを予定していたが、ハイブリダーゼーションキャプチャ法を用いる予定とした。

Causes of Carryover

試薬の価格の変動や、消耗品の消費量によるもの。