2021 Fiscal Year Research-status Report
Search for treatment seeds of high grade renal cell carcinoma
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19K16875
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| Research Institution | Kansai Medical University |
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Principal Investigator |
大江 知里 関西医科大学, 医学部, 講師 (40469242)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 腎細胞癌 / 融合遺伝子 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、非淡明細胞型腎細胞癌を対象にドライバー遺伝子を含む融合遺伝子を探索することを目的としている。2006年から2017年に切除された腎腫瘍638例から候補となりうる22例を選定し、Archer Fusion PLEXを用いて12種類の遺伝子の既知の融合遺伝子とパートナーが未知の融合遺伝子の検索を行ったところ、既知の融合遺伝子 (TFE3-PRCC, TFE3-SFPQ; 各1例) および未知の ALK 融合遺伝子 (1例) が検出された。本年度は3例の臨床病理学的特徴を明らかにし、2022年度病理学会総会で発表を行った。診断時のTNM分類はpT3aN2M0, pT1aN0M0, pT3aN2M0で、pT3aの2例は腫瘍死の経過を辿っていた。TFE3転座型腎細胞癌2例の組織学的特徴は既知の報告に類似していた。ALK融合遺伝子転座を伴う腎細胞癌はこれまでに40例程度の報告があるが、比較的予後良好なものが多く腫瘍死の経過を辿っているものは極めて稀であった。今回検出されたALKの転座パートナーが悪性化に寄与している可能性について、更なる検討を行う予定である。
なお、本研究で発見された融合遺伝子を伴う腎癌は3例のみであったが、今回の研究で構築した腎癌の臨床病理学的データベースを用いて、腎癌の予後やバイオマーカーに関する論文報告を行った。淡明細胞型腎細胞癌に対しては、現在の腎癌の診療において問題となっている血管新生阻害薬と免疫チェックポイント阻害薬をどのように使い分けるかという課題にも取り組んだ。細胞質の色調や腫瘍血管網に基づく組織構築、腫瘍関連免疫細胞の状態をヘマトキシリン・エオジン染色と免疫染色にて評価し、血管新生や腫瘍免疫などの治療奏功性と関連する遺伝子異常に基づく組織形態を解析した。その結果、予後予測や治療戦略に繋がる病理学的新規リスク分類を確立することに繋がった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
融合遺伝子の検索や臨床病理学的特徴の検討が完了し、RNA sequenceデータも取得できている。また、今回の研究で構築されたデータベースを用いた検討による論文報告もできている。今後、行うべき問題点も明確となっているため、順調に進展していると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
ALK転座型腎細胞癌はALK阻害薬の効果が期待されるが、これまで腎癌において阻害薬が投与された文献報告は5例あり、そのうち3例の転座パートナーはALK転座型肺癌で比較的頻度の高いEML4-ALKで部分奏功が得られていた。本研究で発見されたALKの転座パートナーはlong intergenic non-protein coding RNA (LOC100506119)であり、RNA sequenceにおけるALKの発現はALK転座のない症例と比較して有意に高くないことも考慮すると、本転座が治療選択に結び付くものではない可能性がある。今後、1) ALKのbreak apartをFISHにて確認、2) 今回の融合点付近の配列に対するprobeを設計してFISHを実施、3) qRT-PCR を実施し融合遺伝子による転写産物の定量化を行うなどの計画を立てており、臨床的意義について検討する予定である。
また、NGS解析の使用により、non-protein codingの転座パートナーが発見される機会も増えているが、最近uncharacterized geneの意義も注目されつつある。今回発見された転座パートナーは前立腺におけるバイオマーカーとして既に報告されており、この遺伝子が本症例の悪性化に寄与している可能性についてさらなる検討を行い、論文報告を目指す。
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[Journal Article] Histologic-based tumor-associated immune cells status in clear cell renal cell carcinoma correlates with gene signatures related to cancer immunity and clinical outcomes2022
Author(s)
Ohe C, Yoshida T, Ikeda J, Tsuzuki T, Ohashi R, Ohsugi H, Atsumi N, Yamaka R, Saito R, Yasukochi Y, Higasa K, Kinoshita H and Tsuta K.
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Journal Title
Biomedicines
Volume: 10
Pages: 323
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] PBRM1 Immunohistochemical Expression Profile Correlates with Histomorphological Features and Endothelial Expression of Tumor Vasculature for Clear Cell Renal Cell Carcinoma2022
Author(s)
Saiga K*, Ohe C* (*equally contributed), Yoshida T, Ohsugi H, Ikeda J, Atsumi N, Noda Y, Yasukochi Y, Higasa K, Taniguchi H, Kinoshita H, Tsuta K.
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Journal Title
Cancers (Basel)
Volume: 14
Pages: 1062
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Integration of NRP1, RGS5, and FOXM1 expression, and tumour necrosis, as a postoperative prognostic classifier based on molecular subtypes of clear cell renal cell carcinoma2021
Author(s)
Yoshida T, Ohe C, Ikeda J, Atsumi N, Saito R, Taniguchi H, Ohsugi H, Sugi M, Tsuta K, Matsuda T, Kinoshita H.
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Journal Title
J Pathol Clin Res
Volume: 7
Pages: 590-603
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Eosinophilic features in clear cell renal cell carcinoma correlate with outcomes of immune checkpoint and angiogenesis blockade2021
Author(s)
Yoshida T, Ohe C, Ikeda J, Atsumi N, Ohsugi H, Sugi M, Higasa K, Saito R, Tsuta K, Matsuda T, Kinoshita H
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Journal Title
J Immunother Cancer
Volume: 9
Pages: e002922
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Development and validation of a vascularity-based architectural classification for clear cell renal cell carcinoma: correlation with conventional pathological prognostic factors, gene expression patterns, and clinical outcomes2021
Author(s)
Ohe C, Yoshida T, Amin MB, Atsumi N, Ikeda J, Saiga K, Noda Y, Yasukochi Y, Ohashi R, Ohsugi H, Higasa K, Kinoshita H and Tsuta K
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Journal Title
Mod Pathol
Volume: －
Pages: －
DOI
Peer Reviewed
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