Fusion of comprehensive genomic and imaging information in esophageal cancer: Radiogenomics

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K17130
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 52040:Radiological sciences-related
• Research Institution: Chiba University
• Principal Investigator: Hajime Yokota 千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (20649280)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 食道癌 / 扁平上皮癌 / Radiogenomics / Epigenomics

Outline of Final Research Achievements

The serum microRNA-1246, which is considered a strong prognostic marker in esophageal cancer, could be predicted from CT. The predicted serum mircoRNA-1246 was also confirmed to be prognostic. We applied the same method to pancreatic cancer and showed that prognostic genes such as p53, PD-L1, and integrin αV can be predicted by CT. We also developed a gene selection method using deep learning and contributed to the establishment of a research field called Radiogenomics. The results of these studies were published in a review article, and Radiogenomics was widely recognized.

Free Research Field

画像診断

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

食道癌は、遺伝子レベルでの予後因子が模索されてきている。ただ、生検が必要という侵襲性やコストの面で臨床で遺伝子情報を利用するのは難しい。一方、CTやMRI、PETといった画像は日常臨床で必要不可欠であり、必ず撮像されている。Radiogenomicsは、遺伝子と画像との関連を模索する研究領域である。画像は病理像、機能をある程度反映しており、遺伝子発現とも関連した情報を内包していると思われる。画像を解析することで、非侵襲的で低コストに遺伝子情報を得ることが可能になり、食道癌の治療方針決定に寄与することができる。