特発性低身長の網羅的遺伝子解析による新規責任遺伝子の探索

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K17287
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 島 彦仁 東北大学, 大学病院, 助教 (20822878)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 低身長 / 遺伝子解析

Outline of Annual Research Achievements

本研究において、2021年については、本学倫理委員会において承認された計画書（成長障害における遺伝的要因の探索、東北大学大学院 医学系研究科倫理委員会 2019-1-016号）にそって患者コホートの構築、遺伝子解析を進めた。
患者コホートの構築においては、昨年度に引き続き基準を満たす患者を抽出した。順次、各患者に対して研究について説明を行い、両親及び患者本人のインフォームドコンセント又はアセントを取得した患者からは患者のスケジュールされた治療のために必要な血液検査のタイミングで遺伝子検査用の血液の提供を受けた。遺伝子解析を行う研究計画であることから研究参加にあたっては両親などで十分に検討を頂くように説明している。
遺伝子解析については、上記で提供をうけた検体を順次全エクソームシークエンス、また本年度からは全ゲノムシークエンスを行った。2022年度まで約25名の患者から研究参加に同意いただき、うち約20名の患者でwet解析はを終了した。なお、wet解析の終了したデータをより効率的かつ正確に遺伝子変化を同定することを目的に、東北大学メディカルメガバンク
の管理するスーパーコンピューターを活用し、パイプラインを改良している。
なお、SARS-CoV-2の流行に伴い、低身長患者の受診が抑制された影響のため、本研究立案時点よりも低身長患者の受診が大きく減少しており、患者コホートの構築に大きな影響が出ている。
現在、上記の２つの取り組みを進め、低身長の新規責任遺伝子の探索を進めているところである。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

SARS-CoV2流行に伴い、本研究の対象となる低身長患者の受診が大幅に抑制されているため。

Strategy for Future Research Activity

現在対象の患者に対して研究計画を順次説明しており、今後研究に参加頂ける方から検体を頂き検査を進める予定である。また、全ゲノムシークエンスデータの解析パイプラインを最新のデータを反映させながら修正を行ってより実用性を高めるようにしている。
研究計画全体の成果は、研究終了年度中の文献報告を目指し準備を進めている。

Causes of Carryover

SARS-CoV2流行に伴う研究計画の遅延