Elucidation of pathomechanism for vascular Ehlers-Danlos syndrome using a comprehensive approach

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K17795
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 53050:Dermatology-related
• Research Institution: Shinshu University
• Principal Investigator: Yamaguchi Tomomi 信州大学, 学術研究院医学系(医学部附属病院), 助教 (90802835)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 血管型エーラス・ダンロス症候群 / 遺伝性結合組織疾患 / 次世代シークエンス / 分子遺伝学的発症機序

Outline of Final Research Achievements

Ehlers-Danlos syndrome (EDS), classified into 14 subtypes, is characterized by tissue fragility. Vascular EDS can cause fatal complications such as arterial lesions and sigmoid colon rupture. The aim of this study is to elucidate pathomechanism comprehensively for vascular EDS through innovative genetic analyses based on next-generation sequencing (NGS).
A patient with vascular EDS caused by a pathogenic variant detected by copy number variation analysis using NGS data was published in an international journal. No variant was detected either by long-read NGS structural analysis using whole genome or CRISPR/Cas9-based products, or by long-read NGS analysis using long-PCR products from skin fibroblast-derived mRNA or genomic DNA for detecting deep intron variants as well as variants at regulatory regions.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

原因の特定に至った症例は少なかったが、構築した遺伝子解析基盤は研究代表者が担当するEDSの遺伝学的検査体制およびEDS患者の診療の向上に貢献しうるものと考える。また、血管型EDS疑い例の中に、類古典型EDS 1型の診断確定者、保因者をそれぞれ1例見出した。原因遺伝子に両アレル性の病的バリアントを有する前者、および後者の親は消化器関連症状を示した。NGSでの解析が困難とされてきた類古典型1型において独自のNGS解析法を開発したことにより、類古典型1型においても消化器関連症状のリスクが高いことを示した。これは、血管型EDSの分子遺伝学的機序を考える上で重要な所見となった。