沖縄県における成人T細胞白血病／リンパ腫のゲノム解析

2019 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K17835
• Research Institution: University of the Ryukyus
• Principal Investigator: 崎浜 秀悟 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (30835129)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 成人T細胞白血病・リンパ腫（ATL） / ヒトT細胞白血病ウイルスＩ型（HTLV-1） / tax遺伝子型

Outline of Annual Research Achievements

成人T細胞白血病・リンパ腫（ATL）のゲノム異常に関する報告が日本およびアメリカの研究グループより相次いでなされ、地域により遺伝子変異のプロファイルが大きく異なることが報告されている。申請者はATLにおける遺伝子変異の地域差にHTLV-1のtax遺伝子型（ウイルスタイプ）が関わっているとの仮説を立て、検証を行った。現在までに、ターゲットシーケンス解析の結果から、沖縄県におけるATLは複数の遺伝子において変異の頻度が日本本土およびアメリカで行われた過去の研究と異なることが示唆された。その中でも特にGATA3およびRHOA遺伝子の変異は、沖縄県に多いtaxA遺伝子型の症例に多く、これらの遺伝子変異の地域間での頻度の差はHTLV-1のウイルスタイプの違いに起因する可能性が示唆された。一方で、PRKCB、PLCG1、CARD11といったT cell receptor (TCR)/NF-κB経路の遺伝子変異は、本土の症例と同様に高頻度に検出された。これらの変異はアメリカでは低頻度であったことが報告されており、日本人とアメリカ人のATL患者ではTCR/NF-κB経路の重要性が異なる可能性を示唆している。またSNPアレイの結果より、taxA遺伝子型の患者において、RHOA遺伝子のコピー数の増加も多く検出されており、ウイルスタイプの違いが遺伝子の異常に寄与する可能性を強めている。現在、ターゲットシーケンス解析結果とSNPアレイの結果とを統合した解析や、遺伝子異常と予後との関連を解析中である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

沖縄県におけるATLの遺伝子変異プロファイルを明らかにし、一部の遺伝子異常とHTLV-1のウイルスタイプとの関連を示唆する結果が得られた。

Strategy for Future Research Activity

現在、遺伝子変異プロファイルとSNPアレイの結果を統合した解析と、ゲノム異常と予後との関連について解析を進めている。本解析が終わり、ATLの病態形成に関与する重要な遺伝子異常が明らかになった場合、より詳細な解析を実施する。

Causes of Carryover

ターゲットシーケンス解析データとtax遺伝子型を絡めたデータ解析および追加検体、臨床情報の収集、SNPアレイデータの解析などに時間を割いたため予定した使用額を下回った。次年度は追加検体の解析や注目する遺伝子のより詳細な解析を実施する。

Research Products

• [Presentation] Integrated genomic analysis of adult T-cell leukemialymphoma in Okinawa (2019)
  • Author(s): Shugo Sakihama, Kazuho Morichika, Megumi Miyara, Takashi Miyagi, Masaki Hayashi, Junnosuke Uchihara, Takeaki Tomoyose, Sawako Nakachi, Satoko Morishima, Kazuko Sakai, Kazuto Nishio, Hiroaki Masuzaki, Takuya Fukushima, Kennosuke Karube
  • Organizer: 第81回日本血液学会学術集会