2020 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular genetic analysis of congenital thrombocytopenia, hemostatic and coagulation disorder
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19K17865
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Research Institution | Yokohama City University |
Principal Investigator |
内山 由理 横浜市立大学, 附属病院, 助教 (50829794)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | 血小板減少症 / 汎血球減少症 / 全エクソーム解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
小児期に発症する血小板減少症は、免疫原性の血小板減少症や造血器悪性腫瘍、骨髄不全症、先天性血小板減少症の鑑別が必須である。全エクソーム解析により血小板減少症及び汎血球減少症を呈する家系から同定された遺伝子A及びBに対して、RT-PCRやRNAシークエンスを行うことで、各遺伝子及びその下流における発現への影響が評価された。遺伝子Aの機能評価は、1年目に行った患者由来の株化リンパ芽球細胞の変異含有状況では、変異を検出することができなかった。これは変異毒性が強いことが原因として挙げられた。これに対し、再度患者由来の株化リンパ芽球を作成し、1細胞ごとに単離・培養、サンガー法を用いて変異含有細胞の有無を検証したが、変異含有細胞を確認することはできなかった。変異含有率が担保された状況で株化リンパ芽球の作成を2回行っており、変異含有細胞における本バリアントの病原性が高く、生存が困難なため死滅した可能性を強く示唆した。 原因不明の先天性止血・凝固異常症42家系の遺伝学的解析:発端者の全エクソーム解析を42家系全例に対して行い、バリアント評価を行った。この結果、新たに2遺伝子、3家系に先天性血小板減少症、汎血球減少症をきたすバリアントを同定した。病原性の評価が終了次第、論文報告を予定している。 本手法を用いた先天性血小板減少症・止血凝固異常症の遺伝的疾患病態の解明は、非常に効率的であり、今後も有用であることが示された。
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Research Products
(9 results)
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[Presentation] Efficient detection of copy-number variations using whole-exome data: batch- and sex-based analyses2020
Author(s)
Yuri Uchiyama, Kazuhiro Iwama, Satoko Miyatake, Kohei Hamanaka, Naomi Tsuchida, Hiromi Aoi, Yoshiteru Azuma, Toshiyuki Itai, Ken Saida, Hiromi Fukuda, Futoshi Sekiguchi, Tomohiro Sakaguchi, Sachiko Ohori, Ming Lei, Eriko Koshimizu, Atsushi Fujita, Atsushi Takata, Noriko Miyake, Takeshi Mizuguchi, Naomichi Matsumoto
Organizer
日本人類遺伝学会第65回大会