2020 Fiscal Year Research-status Report
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19K17932
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| Research Institution | Osaka City University |
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Principal Investigator |
藤本 康介 大阪市立大学, 大学院医学研究科, 助教 (30802805)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | IgA / 粘膜ワクチン / 腸内細菌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
腸内細菌叢の構成異常（dysbiosis）に対する考え方も時代と共に変化してきており、単純な菌叢の構成割合の変化だけでなく、菌叢が持つ機能も解析することが重要となってきた。そのため、dysbiosis関連疾患の腸内微生物叢が持つ機能（微生物叢が持つ遺伝子群）を網羅的に解析するための解析パイプラインを作成し報告した（Cell Host & Microbe. 2019）。さらに、dysbiosis関連疾患の代表として知られている難治性Clostridioides difficile腸炎に対する糞便移植症例を解析し、糞便移植治療によって微生物叢が有する機能の改善を示した（Gastroenterology. 2020）。肥満症例の微生物叢解析を引き続き行っているが、肥満症例に特徴的な菌の同定のみならず微生物叢の機能解析も重要と考えている。本研究課題で用いるワクチン製剤を、肥満で過剰に亢進している機能にフォーカスして抗原の標的とすることで、菌叢の機能の制御に繋げられる可能性があると考えている。また、昨年度肥満患者で増加しているClostridium ramosumに対するワクチン効果を既に示しており、Clostridium ramosumの腸管内での機能を明らかにすることが重要である。そのため、非肥満者と肥満者それぞれから単離されるClostridium ramosumのショットガンシークエンスや機能解析を行うための準備を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本申請課題では、ヒト肥満に関連する腸内細菌を制御することで、次世代粘膜ワクチンが肥満の病態を改善する新しいツールになることを目的としている。ワクチンのターゲットとなる菌としてClostridium ramosumを既に同定したが、Clostridium ramosumの腸管内での機能が十分に明らかになっていないため、良いワクチン抗原の探索を行うためにもClostridium ramosumが有する機能解析は必要と考えている。ヒトへの臨床応用のため不完全フロイントアジュバントに変わる基剤候補の探索も進んでおり、実験計画通り概ね順調に順調に進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
肥満者に特徴的な腸内細菌については、Clostridium ramosumを中心として解析を継続する。引き続き、ヒトへの臨床応用に向けて、ワクチン製剤としての実用性（作製方法なども含めて）や安全性についても検討を進める。
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| Causes of Carryover |
本年度の研究においては、購入済みの一般的な試薬から施行可能なものが多く含まれていた。また新型コロナ感染症の影響により、一部動物実験のスケジュールが変更になった。次年度、物品費を中心に研究を進めるために使用する。
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[Journal Article] Functional Restoration of Bacteriomes and Viromes by Fecal Microbiota Transplantation2021
Author(s)
Fujimoto K, Kimura Y, Allegretti JR, Yamamoto M, Zhang YZ, Katayama K, Tremmel G, Kawaguchi Y, Shimohigoshi M, Hayashi T, Uematsu M, Yamaguchi K, Furukawa Y, Akiyama Y, Yamaguchi R, Crowe SE, Ernst PB, Miyano S, Kiyono H, Imoto S, Uematsu S.
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Journal Title
Gastroenterology
Volume: －
Pages: －
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Metagenome Data on Intestinal Phage-Bacteria Associations Aids the Development of Phage Therapy against Pathobionts2020
Author(s)
Fujimoto K., Kimura Y., Shimohigoshi M., Satoh T., Sato S., Tremmel G., Uematsu M., Kawaguchi Y., Usui Y., Nakano Y., Hayashi T., Kashima K., Yuki Y., Yamaguchi K., Furukawa Y., Kakuta M., Akiyama Y., Yamaguchi R., Crowe SE., Ernst PB., Miyano S., Kiyono H., Imoto S., Uematsu S.
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Journal Title
Cell Host & Microbe
Volume: 28
Pages: 380～389.e9
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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