2020 Fiscal Year Research-status Report
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19K18326
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
稲川 嵩紘 広島大学, 医療政策室, 特任助教 (30773783)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | S. aureus / MRSA / MSSA / DNAシークエンス / DNA解析 / 病原因子 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでの様々な報告や論文から、S. aureusの保有する病原因子は、遺伝子タイプ毎に規定されることが知られており、肺炎とS. aureusの関連性を調べることにおいて、本邦に存在するS. aureusの遺伝子タイプの割合と、肺炎の原因菌となったS. aureusの遺伝子タイプを比較することで、肺炎を比較的引き起こしやすい遺伝子タイプのS. aureusを同定する方針とした。ただ、現在の本邦に優位に存在する、S. aureusの遺伝子タイプの疫学的研究がほとんどなく、まずBaseとなるS. aureusの疫学的検討を行った。
そのため、広島大学病院高度救命救急センター・ICUに2017年6月1日から2019年5月31日の間に入室し、入室時に鼻腔スワブ培養を提出されている患者から検出されたS, aureusを対象に遺伝子解析を行い、当施設入院患者が保菌するS. aureusの遺伝子タイプの割合を検討した。
結果は、MSSA保菌者390人、MRSA保菌者136人、MRSA＋MSSA保菌者2人、どちらも保菌していないもの1423人であった。MRSA保菌者は入室患者の7.1％、MSSA保菌者は20.0%であった。検出された黄色ブドウ球菌に対するMRSAの割合は25.7％であった。これらのMRSA、MSSA株に関して、DNAシークエンスを行った。DNAシークエンス施行したのは、MRSA118株、MSSA328株であった。現在このDNAシークエンスの結果に基づき、本邦に存在するS. aureusの遺伝子タイプを同定する作業を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
S. aureus肺炎の原因菌株を収集するより前に、S. aureusの疫学的検討を行う必要があり、そのS. aureus株の収集、保存、DNA抽出、DNA解析、また患者情報をカルテから得るにあたり多くの時間を要した。これらの菌株の収集は終了し、ゲノムシークエンスは終了した。ただ、まずは疫学的検討をまとめている最中であり、肺炎の病原因子まで検索はできていない。
また、今年度は新型コロナウイルスの影響で、実験室の出入りの制限もあったことや、集中治療分野での診療に時間を費やしてしまい、研究に割ける時間が少なかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
収集したS .aureusのDNA解析を行い、遺伝子タイプと保有する病原因子を検出する。また、S. aureus肺炎を発症したS. aureus株についても同様に遺伝子タイプと保有する病原因子を検出する。BaseのS. aureusと肺炎の原因菌株で遺伝子タイプと保有する病原因子の違いを検討することで、肺炎との関連性を見出す。
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| Causes of Carryover |
2020年度に行った研究で使用した実験器具、試薬などは、当施設に元々保管されていた試薬を使用しており、同年度に使用した研究費は特になく、次年度以降の
研究費として使用する。2021年度はDNA解析を進めていくうえで、必要な試薬の費用や研究成果の学会発表などの旅費に研究費を用いる予定である。
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