2020 Fiscal Year Research-status Report
小児もやもや病RNF213レアバリアントを用いたバイオマーカー探索
Project/Area Number |
19K18443
|
Research Institution | Tokyo Women's Medical University |
Principal Investigator |
野村 俊介 東京女子医科大学, 医学部, 助教 (40770996)
|
Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
|
Keywords | もやもや病 / RNF213 / レアバリアント |
Outline of Annual Research Achievements |
我々は先行研究にて、RNF213遺伝子の他のレアバリアントももやもや病と有意に関連することを報告し、p.R4810K以外のレアバリアントのRNF213遺伝子の機能や病態発症と重症度への影響を考えている。 2018年、我々は、小児もやもや病における未報告変異を含むレアバリアント症例[Akagawa and Nomura.et al. Hum Genome Var, 2018]や、RNF213 p.R4810K陰性症例でもp.R4810Kより遺伝学的な障害度予測スコア(CADD-C score)が高値のレアバリアントを有し、もやもや病の発症や重症な臨床経過に与える可能性(J neurosurg, 2018, Nomura.et al)を報告した。 今回、遺伝学的要因が成人に比べ高いと予想される小児もやもや病においてRNF213遺伝子の全コーディング領域のリシーケンスを行ない、レアバリアントの病態発症・重症度への影響を検討した。小児もやもや病患者63人においてRNF213 p.R4810Kと他のレアバリアントを含むすべての変異に関してのgenotype-phenotype correlationを解析した. 発症年齢15歳以下のもやもや病患者63例において, RNF213遺伝子全コーディングエクソンのTarget Reseqenceを行った. 脳梗塞発症と長期脳卒中リスクは, p.R4810Kヘテロ変異単独/全変異なしに比較し, p.R4810Kホモ変異と他のレアバリアントで有意に高かった. 従来言われていたRNF213 p.R4810Kホモ変異だけでなく, 一部の他のRNF213のレアバリアントも臨床経過に影響を与える可能性が示唆された.
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
63症例の小児もやもや病患者のDNA抽出はすでに終了しており、次世代シーケンサーIon PGM(Thermo Fisher Scientific)を使用し、RNF213のすべてのcoding exonのターゲットリシークエンスは終了している。追加の症例をシークエンスを行い、データをまとめている。
|
Strategy for Future Research Activity |
必要時症例を追加し、RNF213遺伝子解析を行う。データをまとめ論文投稿を行い、受理を目指す。
|
Causes of Carryover |
コロナウイルスの影響で実験計画がわずかに遅れたためと海外学会の参加はすべて困難だった。症例を増やし追加のシークエンスを行う。
|