2021 Fiscal Year Annual Research Report
網羅的ゲノム解析による尿路上皮癌の分子病態の解明と個別化医療への応用
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19K18576
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
佐藤 悠佑 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (20372378)
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2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 腎盂尿管癌 / 上部尿路上皮癌 / 分子サブタイプ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
東京大学医学部附属病院泌尿器科において腎尿管全摘除術を行った腎盂尿管癌200症例について手術検体を採取し、全エクソンシークエンシングによる網羅的な遺伝子変異解析、RNAシークエンシングによる網羅的な遺伝子発現解析を行った。その結果、腎盂尿管癌の約5%では遺伝子変異の頻度が10/Mbを超えるようなhypermutatedな状態となっていた。これらの症例ではMSH2遺伝子やMSH6遺伝子などDNAミスマッチ修復に関連する遺伝子異常がみられ、リンチ症候群に関連した発症であることが推測された。また、TP53遺伝子変異、FGFR3遺伝子変異、RAS遺伝子群の変異がほぼ排他的に存在し、遺伝子変異に基づいた病型分類が可能であることが明らかになった。これらの病型は、臨床的な特徴とよく相関しており、TP53遺伝子変異群は高悪性度の腫瘍が多く予後不良であったのに対し、FGFR3遺伝子変異群は低悪性度のものが多く予後良好であった。また、遺伝子発現のプロファイルにも、遺伝子変異のパターンとの強い関連が見られた。これらの知見に基づいて分子サブタイプに分類することによって治療方針の検討を行うことが可能となることが示唆された。
さらに、術前および術後の尿検体も蓄積しており、これらの尿沈渣からDNAを抽出し遺伝子変異解析を行った。術前の尿からは感度よく癌細胞由来の遺伝子変異を検出できている一方、術後の尿からはそれらの変異は検出されなかった。現在診療で標準的に用いられている尿細胞診と比較して、より高感度に癌を診断できる可能性が高いと考えられた。
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