2019 Fiscal Year Research-status Report
Elucidation of the mechanism to control keratinization in normal stratified squamous cell and squamous cell carcinoma derived from oral mucosa
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19K18973
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| Research Institution | Matsumoto Dental University |
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Principal Investigator |
嶋田 勝光 松本歯科大学, 歯学部, 助教 (10782120)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 角化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
角化・分化度の異なる正常上皮および腫瘍性上皮を含むOTCコンパウンド包埋凍結検体からRNAを抽出後、シークエンス解析を行い、各種上皮間で発現に差がみられるマーカー遺伝子群を解析中である。正常上皮では非角化を示す頬粘膜と舌側縁上皮と角化を示す口蓋と歯肉上皮、上皮内癌では角化傾向の乏しい全層置換型と角化傾向を示す表層分化型、扁平上皮癌では分化度の非常に高い疣贅癌、高分化型扁平上皮癌、中分化型扁平上皮癌を検索している。
シークエンス解析から得られた遺伝子群が、高分化型の上皮性腫瘍の診断に応用可能かを確認するため、正常上皮および腫瘍性上皮を含む症例群のホルマリン固定パラフィン包埋検体（FFPE）からRNAの抽出を行っている。
また、FFPE検体を用いた免疫染色およびPCRにより、角化に深く関与する周辺帯関連タンパク質の基質および架橋酵素の局在と遺伝子発現が正常な口腔粘膜の角化に関与することを統計学的に示した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ホルマリン固定パラフィン包埋検体（FFPE）から抽出したRNAのRIN値がシークエンス解析における規定値に達さず、FFPE 検体からの解析を中断した。そのため、OTCコンパウンド包埋凍結検体からのRNA抽出に切り替えたので解析までに遅延が生じた。
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| Strategy for Future Research Activity |
シークエンス解析結果に基づき、正常および腫瘍における分化を制御する遺伝子群を決定する。さらに正常歯肉上皮および口腔扁平上皮癌の細胞培養を行い、マーカー遺伝子の導入に備える。
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| Causes of Carryover |
ホルマリン固定パラフィン包埋検体（FFPE）から抽出したRNAのRIN値がシークエンス解析における規定値に達さず、FFPE 検体からの解析を中断した。そのため、OTCコンパウンド包埋凍結検体からのRNA抽出に切り替えたことにより、解析までの遅延が生じた。よって、現在シークエンス解析を受託中であるため、本解析費用を含む次年度使用額が生じている。
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