Establishment of a method to automatically collect laboratory test values without bias and application to clinical epidemiological research

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K19389
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 58010:Medical management and medical sociology-related
• Research Institution: Kochi University
• Principal Investigator: Hyohdoh Yuki 高知大学, 教育研究部医療学系連携医学部門, 助教 (50821964)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 臨床検査値 / 検査オーダ / 教師無し学習 / フェノタイピング

Outline of Final Research Achievements

We developed a new approach for extracting the laboratory test values that are clinically acceptable and estimating the distributions and reference intervals from the electronic health record. Our approach interprets the intervals until the next laboratory test order as information that includes the physician's clinical decision. We resampled the data using the test interval until the next laboratory test order as a weight, and a set of clinically acceptable laboratory test values was identified. In addition, in order to verify the validity of the estimated reference intervals in hemoglobin, we compared it with the relationship between iron prescription and laboratory test values. Results show that the approach can estimate age-specific reference intervals of multiple clinical laboratory tests. This approach is a simple method of estimating useful distributions and reference intervals including the clinical decision of physicians.

Free Research Field

医療情報学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

診療データは単純に解析すると、誤った結論を導くことが多い。その理由の一つは、診療データには欠損値が多く存在し、そのまま解析に利用すると偏り（バイアス）を伴った結果となる可能性が高くなるためである。さらに医療現場においては「健康な人ほど検査が不要」など、患者の状態に応じてデータの発生確率が変動するためデータが欠損するプロセスが複雑である。本研究では、欠損値への対処方法の1つとして、これらの臨床医の判断を含めて検査値が取りうる値の分布を推定するための手法を確立した。これらの手法や分布を活用することにより、根拠のある欠損値の代入が可能となり、より蓄積された医療データの利活用がなされると期待できる。