2021 Fiscal Year Annual Research Report
分岐鎖アミノ酸のゲノムワイド関連解析とメンデル無作為化による膵がんの分子疫学研究
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19K19473
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
片桐 諒子 国立研究開発法人国立がん研究センター, がん対策研究所, 室長 (60813508)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 分子疫学 / メンデル無作為化 / 操作変数法 / 分岐鎖アミノ酸 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、マーカーや治療に活用しうる可能性をもつ分岐鎖アミノ酸（BCAA）の遺伝要因の解明および疾患（特に膵がん）とのメンデル無作為化解析を目的として、①操作変数となるBCAA濃度に関連する一塩基多型（SNP）の選定、②BCAA濃度に関連するSNPと血中BCAA濃度の関連解析、③BCAA濃度に関連するSNPとOutcome（がん）の関連解析を利用して、④Two-sampleアプローチによるメンデル無作為化解析を予定した。
①GWAS Catalogおよび既報のBCAA濃度に関するMR解析研究の論文からBCAA濃度に関連するSNPを選定した。ロイシン18SNP,イソロイシン19SNP、およびバリン11SNPが報告されており、次に、基準に基づき選定を実施したところ最終的にロイシン3SNP,イソロイシン5SNP、およびバリン2SNPが選択された。②日本人集団において、BCAA濃度に関連するSNPと血中BCAA濃度の関連解析を実施し、効果の推定量を得る必要がある。東北メディカルメガバンクとの共同研究により約15000名の日本人成人を対象としたゲノムワイド関連解析（GWAS）を実施し、①で抽出したSNPにおける効果の推定量を検出した。③本研究は、膵がんに対するメンデルのランダム化解析を実施すべく、膵がんでの解析の可能性を検討したものの、症例数が少なく、症例数の多いコンソーシアムなども検討したものの本研究での実施は困難と判断し、アウトカムをより症例数の多い大腸がんでの検討へ変更することとした。④最終的にBCAA濃度に対する遺伝的な説明率が、既報から選択したSNPでは非常に低い（１％未満）であることがわかり、これらのSNPによる操作変数法であるメンデル無作為化解析は実施が困難であると結論づけた。
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