人工核酸LNAを用いた日本人集団における高感度メチル化解析と年齢推定への応用

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K19477
• Research Institution: Asahikawa Medical College
• Principal Investigator: 磯崎 翔太郎 旭川医科大学, 大学病院, 医員 (60834504)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 人工核酸

Outline of Annual Research Achievements

昨年度に引き続き、7領域のSNP(PTPN7, SST, CNGA3, KLF14, TSSK6, TBR1, SLC12A5)の一塩基伸長法によるメチル化率測定法に対し、PrimerへのLNA導入により増幅効率の改善効果が認められるか検証した。マルチプレックスPCRの段階において、各Primerの5'末端側ににLNAを2塩基導入したPrimerを設計し、0%,50%,100%のメチル化率のstandard DNA 10ng に対してメチル化率測定を行い、LNA未導入のPrimerを用いた場合と比較した。その結果、LNA導入のprimerを使用した場合、7領域中6領域でキャピラリー電気泳動時の相対蛍光単位の増高が認められた。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

SARS-CoV-2の世界的な蔓延により所属機関での研究活動が制限された。また研究の遂行に必要な消耗品の購入も遅れたため、本研究課題の進歩状況が遅れている。

Strategy for Future Research Activity

ヒト培養細胞から抽出したDNAに対してバイサルファイト処理、メチル化率測定を行い、同様に検出効率の改善効果が認められるか検証する。得られた研究成果をまとめ、学会発表・論文作成を行う。

Causes of Carryover

COVID-19蔓延により研究に必要な消耗品の購入が遅れたため。次年度以降も研究活動に必要な消耗品及び研究成果発表のための旅費に充当する予定である。

Research Products

• [Int'l Joint Research] カロリンスカ研究所(スウェーデン)
  • Country Name: SWEDEN
  • Counterpart Institution: カロリンスカ研究所
• [Journal Article] Polyphosphate, Derived from Lactobacillus brevis, Modulates the Intestinal Microbiome and Attenuates Acute Pancreatitis (2021)
  • Author(s): Takauji Shuhei、Konishi Hiroaki、Fujiya Mikihiro、Ueno Nobuhiro、Tanaka Hiroki、Sato Hiroki、Isozaki Shotaro、Kashima Shin、Moriichi Kentaro、Mizukami Yusuke、Okumura Toshikatsu
  • Journal Title: Digestive Diseases and Sciences Volume: 1 Pages: 1
  • DOI: 10.1007/s10620-020-06747-9
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] The Optimal Dose of Tacrolimus in Combination Therapy with an Anti-TNFα Antibody in a Mouse Colitis Model (2021)
  • Author(s): Murakami Yuki、Fujiya Mikihiro、Konishi Hiroaki、Isozaki Shotaro、Sugiyama Yuya、Kobayashi Yu、Sasaki Takahiro、Kunogi Takehito、Takahashi Keitaro、Ando Katsuyoshi、Ueno Nobuhiro、Kashima Shin、Moriichi Kentaro、Tanabe Hiroki、Okumura Toshikatsu
  • Journal Title: Biological and Pharmaceutical Bulletin Volume: 44 Pages: 564～570
  • DOI: 10.1248/bpb.b20-00916
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Probiotic-Derived Polyphosphate Accelerates Intestinal Epithelia Wound Healing through Inducing Platelet-Derived Mediators (2021)
  • Author(s): Isozaki Shotaro、Konishi Hiroaki、Fujiya Mikihiro、Tanaka Hiroki、Murakami Yuki、Kashima Shin、Ando Katsuyoshi、Ueno Nobuhiro、Moriichi Kentaro、Okumura Toshikatsu
  • Journal Title: Mediators of Inflammation Volume: 2021 Pages: 1～14
  • DOI: 10.1155/2021/5582943
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Low temperature induces von-willebrand factor expression via increased early growth response 1 transcriptional activity in splenic sinusoidal endothelial cells (2020)
  • Author(s): Horioka Kie、Tanaka Hiroki、Isozaki Shotaro、Konishi Hiroaki、Addo Lynda、Takauji Shuhei、Druid Henrik
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications Volume: 526 Pages: 239～245
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2020.03.073
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Rewarming from accidental hypothermia enhances whole blood clotting properties in a murine model (2020)
  • Author(s): Horioka Kie、Tanaka Hiroki、Isozaki Shotaro、Konishi Hiroaki、Addo Lynda、Takauji Shuhei、Druid Henrik
  • Journal Title: Thrombosis Research Volume: 195 Pages: 114～119
  • DOI: 10.1016/j.thromres.2020.07.022
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Presentation] 乳酸菌由来長鎖ポリリン酸は血小板活性化を介して腸管上皮の創傷治癒を促進する (2020)
  • Author(s): 磯崎翔太郎、藤谷幹浩、小西弘晃、田中宏樹、村上雄紀、杉山雄哉、 安藤勝祥、上野伸展、後藤拓磨、嘉島 伸、高氏修平、盛一健太郎、 田邊裕貴、水上裕輔、奥村利勝
  • Organizer: 第57回日本消化器免疫学会総会
• [Presentation] The activation of Wnt signaling in the murine frostbite model (2020)
  • Author(s): Shotaro Isozaki, Hiroki Tanaka, Kie Horioka, Hiroaki Konishi, Shin Kashima, Henrik Druid
  • Organizer: 第104次日本法医学会学術全国集会
• [Presentation] PROBIOTIC-DERIVED POLYPHOSPHATE IMPROVES DAMAGED INTESTINAL EPITHELIA THROUGH INDUCING PLATELET-DERIVED CELL GROWTH MOLECULES (2020)
  • Author(s): Shotaro Isozaki , Mikihiro Fujiya , Hiroaki Konishi et al.
  • Organizer: Digestive Disease Week 2020
  • Int'l Joint Research
• [Remarks] 研究者詳細（磯崎翔太郎）
  • URL: http://hyouka04.asahikawa-med.ac.jp/html/100000707_ja.html
• [Patent(Industrial Property Rights)] 血小板凝集剤 (2020)
  • Inventor(s): 藤谷幹浩,小西弘晃,田中宏樹,磯崎翔太郎,大町佳宏,尾川直樹
  • Industrial Property Rights Holder: 藤谷幹浩,小西弘晃,田中宏樹,磯崎翔太郎,大町佳宏,尾川直樹
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 特願2020-1319