causal SNV探索を通じたApoA1遺伝子の新たな発現調節機構の解明

2019 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K20175
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 會田 雄一 筑波大学, 医学医療系, 助教 (60752152)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 生活習慣病

Outline of Annual Research Achievements

次世代シークエンサーは世界中で膨大な量の塩基情報を生み出しており、医療のみならずヘルスケアへの応用が期待される。この第一歩は、次世代シークエンサーから得られた塩基情報と、人種や地域、生活習慣など様々な環境下で得られる表現型を組み合わせる解析である。こうした遺伝統計学的な解析によって得られた知見をさらに、生活習慣病の個別化医療や予防医療に役立てるためには、真に機能を有する「疾患関連変異」の機能解析を分子生物学的な実験によって進める必要がある。本研究では、エンハンサーやプロモーターといった遺伝子制御部位に位置する一塩基バリアント（single-nucleotide variant: SNV）が、血中HDLレベルを規定するメカニズムを実験的に解明することを目的とした。これまでに、HDLの主要アポリポタンパクであるApoA1のプロモーターに位置し転写活性に影響を与えるSNVを新たに同定した。そして、このSNVが位置するDNAエレメントに「タンパクX」が結合してApoA1の転写を正に制御することを明らかにした。これらの結果をもとに、タンパクXの機能解析を進めた。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ApoA1のプロモーターに位置し転写活性に影響を与えるSNVと、このSNVが位置するDNAエレメントに結合してApoA1の転写を正に制御するタンパクXの解析を進めた。

Strategy for Future Research Activity

ApoA1のプロモーターに位置し転写活性に影響を与えるSNVと、このSNVが位置するDNAエレメントに結合してApoA1の転写を正に制御するタンパクXの解析を継続する。

Causes of Carryover

実験の進捗状況により、物品の調達が遅れたため。可及的すみやかに実験計画を進め、使用予定の物品の調達を行う。

Research Products

• [Journal Article] Hepatocyte ELOVL Fatty Acid Elongase 6 Determines Ceramide Acyl‐Chain Length and Hepatic Insulin Sensitivity in Mice (2020)
  • Author(s): Matsuzaka T、Kuba M、Koyasu S、Yamamoto Y、Motomura K、Arulmozhiraja S、Ohno H、Sharma R、Shimura T、Okajima Y、Han SI、Aita Y、Mizunoe Y、Osaki Y、Iwasaki H、Yatoh S、Suzuki H、Sone H、Takeuchi Y、Yahagi N、Miyamoto T、Sekiya M、Nakagawa Y、Ema M、Takahashi S、Tokiwa H、Shimano H
  • Journal Title: Hepatology
  • DOI: 10.1002/hep.30953
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The detection of trans gene fragments of hEPO in gene doping model mice by Taqman qPCR assay (2020)
  • Author(s): Aoki Kai、Sugasawa Takehito、Yanazawa Kouki、Watanabe Koichi、Takemasa Tohru、Takeuchi Yoshinori、Aita Yuichi、Yahagi Naoya、Yoshida Yasuko、Kuji Tomoaki、Sekine Nanami、Takeuchi Kaoru、Ueda Haruna、Kawakami Yasushi、Takekoshi Kazuhiro
  • Journal Title: PeerJ Volume: 8 Pages: e8595～e8595
  • DOI: 10.7717/peerj.8595
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Characterization of Osteoarthritis in a Medial Meniscectomy-Induced Animal Model Using Contrast-Enhanced X-ray Microtomography (2020)
  • Author(s): Sugasawa Takehito、Kuji Tomoaki、Aoki Kai、Yanazawa Koki、Takenouchi Akiko、Watanabe Makoto、Tome Yoshiya、Takeuchi Yoshinori、Aita Yuichi、Yahagi Naoya、Shishikura Yasuhiro、Ono Seiko、Yoshida Yasuko、Kawakami Yasushi、Takekoshi Kazuhiro
  • Journal Title: Biomedicines Volume: 8 Pages: 56～56
  • DOI: 10.3390/biomedicines8030056
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A Synonymous VHL Variant in Exon 2 Confers Susceptibility to Familial Pheochromocytoma and von Hippel-Lindau Disease (2019)
  • Author(s): Flores SK、Cheng Z、Jasper AM、Natori K、Okamoto T、Tanabe A、Gotoh K、Shibata H、Sakurai A、Nakai T、Wang X、Zethoven M、Balachander S、Aita Y、Young W、Zheng S、Takekoshi K、Nakamura E、Tothill RW、Aguiar RCT、Dahia PLM
  • Journal Title: The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism Volume: 104 Pages: 3826～3834
  • DOI: 10.1210/jc.2019-00235
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Detection of Transgenes in Gene Delivery Model Mice by Adenoviral Vector Using ddPCR (2019)
  • Author(s): Sugasawa Takehito、Aoki Kai、Watanabe Koichi、Yanazawa Koki、Natsume Tohru、Takemasa Tohru、Yamaguchi Kaori、Takeuchi Yoshinori、Aita Yuichi、Yahagi Naoya、Yoshida Yasuko、Tokinoya Katsuyuki、Sekine Nanami、Takeuchi Kaoru、Ueda Haruna、Kawakami Yasushi、Shimizu Satoshi、Takekoshi Kazuhiro
  • Journal Title: Genes Volume: 10 Pages: 436～436
  • DOI: 10.3390/genes10060436
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 多価不飽和脂肪酸(PUFA)によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2019)
  • Author(s): 升田 紫, 矢作 直也, 武内 謙憲, 和田 亘弘, 呼延 宜人, 李 恩旭, Mehrazad Saber Zahra, 沢田 義一, 村山 友樹, 會田 雄一, 西 真貴子[辰巳], 泉田 欣彦, 飯塚 陽子, 位高 啓史, 片岡 一則, 島野 仁, 門脇 孝
  • Organizer: 第62回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] 糖と脂肪酸のエネルギー基質動員を制御する分子基盤の探求 (2019)
  • Author(s): 泉田 欣彦, 和田 亘弘, 矢作 直也, 武内 謙憲, 李 恩旭, 呼延 延人, 升田 紫, 沢田 義一, 戸谷 直樹, 朴 賢英, 會田 雄一, 志鎌 明人, 飯塚 陽子, 島野 仁, 山内 敏正, 門脇 孝
  • Organizer: 第62回日本糖尿病学会年次学術集会
• [Presentation] SNP rs7074440は肝細胞において転写因子C-FOSとの結合を介してTCF7L2遺伝子発現を調節している機能性SNPである (2019)
  • Author(s): 武内 謙憲, 矢作 直也, 朴 賢英, 會田 雄一, 村山 友樹, Saber Zahra Mehrazad, 何 敏煕, 升田 紫, 泉田 欣彦, 宮本 崇史, 関谷 元博, 松坂 賢, 中川 嘉, 川上 康, 島野 仁
  • Organizer: 第51回日本動脈硬化学会総会・学術集会
• [Presentation] Hepatic KLF15 is involved in lipogenesis via inhibitory effect on SREBP-1c promoter during fasting (2019)
  • Author(s): 武内謙憲, 矢作直也, 會田雄一, 村山友樹, Zahra Mehrazad-Saber, 何敏熙, 和田亘弘, 李恩旭, 呼延宜人, 升田紫, 泉田欣彦, 島野仁
  • Organizer: IDF (International Diabetes Federation) Congress 2019
  • Int'l Joint Research
• [Remarks] 筑波大学医学医療系ニュートリゲノミクスリサーチグループ
  • URL: http://nutrigenomics.umin.jp/