Whole-genome analysis of antimicrobial-resistant Enterobacterales in river water

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K20461
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 63040:Environmental impact assessment-related
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: Gomi Ryota 京都大学, 工学研究科, 助教 (30794284)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 薬剤耐性菌 / 腸内細菌科細菌 / ゲノム解析

Outline of Final Research Achievements

The increase of antimicrobial-resistant bacteria is a global health concern. In the present study, we sequenced the genomes of carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) recovered from river and lake water. The results indicated that environmental CRE carry rare/novel carbapenemases, such as FRI, GES-5, IMI, SFC, and SFH-1.

Free Research Field

環境微生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、環境水中の薬剤耐性菌は、臨床現場では珍しい薬剤耐性遺伝子を保有することが判明した。これらの薬剤耐性遺伝子を保有した薬剤耐性菌が実際に人々に取り込まれ、アウトブレイクを引き起こすかは、今のところわかっておらず、今後の研究で明らかにしていく必要がある。しかし、本研究では臨床現場でも報告例のあるカルバペネマーゼと菌種の組み合わせが検出されたことから、今後注意して環境由来の薬剤耐性菌をモニタリングしていく必要があることが示唆された。