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2019 Fiscal Year Annual Research Report

超好熱性古細菌由来ペルオキシレドキシンを基盤とする新規人工金属酵素の開発

Research Project

Project/Area Number 19K21133
Allocation TypeMulti-year Fund
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

氷見山 幹基  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (90828310)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2020-03-31
Keywords人工金属酵素 / 金属錯体 / タンパク質 / ペルオキシレドキシン
Outline of Annual Research Achievements

人工の金属錯体触媒をタンパク質に固定した人工金属酵素は、触媒の反応性・選択性をタンパク質骨格の最適化により向上可能である。本提案では、超好熱性古細菌由来ペルオキシレドキシンPrxを足場タンパク質とした人工金属酵素開発を計画した。Prxは極めて熱に強いため、高温での利用が期待できる。また、Prxは酸化処理により分子集合状態をコントロール可能であり、人工金属酵素の触媒部位の集積という新たな開発の方向性を展望できる。
Aeropyrum pernix K1由来Prx(ApPrx)を足場タンパク質として鉄二核ヒドロゲナーゼモデル錯体を結合し、水素発生反応を触媒する人工金属酵素を開発した。この鉄二核錯体がタンパク質へ定量的に結合可能であり、結合の結果水中で安定に分散可能であることを確かめた。水素発生触媒としての活性を評価しており、論文を執筆中である。
また、ApPrxの四次構造変換に関する知見も得た。ApPrx はホモ二量体が5つ集合した特徴的なリング状十量体構造を形成する。ApPrxの十量体を構成するホモ二量体間のアミノ酸残基に変異をかけると、十量体構造をホモ二量体に解離できることを見出した。結晶構造解析および溶液中でのサイズ評価によりこれを確認した。リング状十量体構造の役割の解明や、酸化還元に頼らず人工金属酵素の分子集合状態をコントロールする上で重要な知見である。この内容に関して論文を報告した。
構造未知のPrxであったThermococcus kodakaraensis由来Prx(TkPrx)の結晶構造を解明し、論文を報告した。ApPrxと異なるリング状十二量体構造を形成したことから、人工金属酵素の新たな足場タンパク質として有望である。

  • Research Products

    (7 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Disassembly of the ring‐type decameric structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 by amino acid mutation2020

    • Author(s)
      Himiyama Tomoki、Nakamura Tsutomu
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 29 Pages: 1138~1147

    • DOI

      10.1002/pro.3837

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distinct molecular assembly of homologous peroxiredoxins from Pyrococcus horikoshii and Thermococcus kodakaraensis2019

    • Author(s)
      Himiyama Tomoki、Oshima Maki、Uegaki Koichi、Nakamura Tsutomu
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 166 Pages: 89~95

    • DOI

      10.1093/jb/mvz013

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Controlling ring-type assembly of peroxiredoxin by chemical modification2020

    • Author(s)
      氷見山幹基、中村努
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
  • [Presentation] Aeropyrum pernix K1由来ペルオキシレドキシンの環状四次構造を解離する変異導入2019

    • Author(s)
      氷見山幹基、中村努
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会
  • [Presentation] 変異導入によるペルオキシレドキシンの環状四次構造解離2019

    • Author(s)
      氷見山幹基、中村努
    • Organizer
      第18回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
  • [Presentation] 環状十量体タンパク質Aeropyrum pernix K1由来ペルオキシレドキシンの集合挙動制御2019

    • Author(s)
      氷見山幹基、中村努
    • Organizer
      第13回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] Controlling ring-type decameric assembly of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 by combining amino acid mutation and chemical modification2019

    • Author(s)
      Tomoki Himiyama, Tsutomu Nakamura
    • Organizer
      16th Conference on the Asian Crystallographic Association
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-01-27  

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