心筋細胞の老化を定義づけるエピジェネティック変動の解明

2019 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K21600
• Research Institution: National Cardiovascular Center Research Institute
• Principal Investigator: 白井 学 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, オープンイノベーションセンター, 室長 (70294121)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 若林 真樹 国立研究開発法人国立循環器病研究センター, オープンイノベーションセンター, 室長 (70552024)
• Project Period (FY): 2019-06-28 – 2022-03-31
• Keywords: 老化 / 心臓組織 / エピジェネティック変動

Outline of Annual Research Achievements

目的：加齢や疾患による心機能の低下を抑制・防止する薬剤等を開発し、高齢者の生活の質を向上し、医療費の増大を防ぐ有効な手段を構築することを目指す。
研究実績：
1.RNA-seq解析による、網羅的な遺伝子発現解析：これまで若年期（12週令）および壮年期（12ヶ月令）の野生型およびPcgf5KOマウス左心室組織を用いてRNA-seq解析を行ってきたが、本年度は老年期（16ヶ月令）の野生型およびPcgf5KOマウス左心室を用いてRNA-seq解析を行った。若年期と壮年期の間で発現変動する約800遺伝子の同定に成功し、一部は炎症に関連する遺伝子群であることがわかっている。また、Pcgf5KOマウス特異的に発現変動する遺伝子についても同定を行い、解析を進めた。
2.網羅的なヒストン修飾変動解析：それぞれの週令における、ヒストン修飾変動の網羅的解析を開始した。
3.ATAC-seq解析：それぞれの週令における、構造が変化する染色体領域を解析するために、ATAC-seq解析の体制を構築した。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

ヒストン修飾変動解析のためにプロテオーム解析を開始したが、解析機器の故障により現在は、修理が完了するまで解析を停止している。現在、新型コロナの影響により、モデルマウスの実験が停止されており、今後の影響が大きいと予想される。

Strategy for Future Research Activity

1.RNA-seq解析による、網羅的な遺伝子発現解析：既に網羅的なシーケンスデーターを得ることができたので、加齢とともに変動する遺伝子発現の詳細な解析を行う。
2.網羅的なヒストン修飾変動解析：機器の修理完了後に改めてプロテオーム解析を行う。
3.ATAC-seq解析：解析体制は構築できたので、ATAC-seq解析を開始する。

Causes of Carryover

（理由）
プロテオーム解析機器の故障により、解析に遅延が生じている。また、国立循環器病研究センター移転のために壮年期、老年期マウスの準備に時間がかかっている。
（使用計画）
プロてオーム解析機器の修理が完了次第、解析を再開する。