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2019 Fiscal Year Research-status Report

天然物の閉環様式を活用した膜透過キメラペプチドの開発

Research Project

Project/Area Number 19K22243
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

後藤 佑樹  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (70570604)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Keywordsペプチド / 擬天然物 / RiPP / チオペプチド
Outline of Annual Research Achievements

次世代型の創薬候補分子として、中分子サイズの環状ペプチドが近年注目されている。申請者らの研究グループではこれまでに、人工翻訳系を駆使した環状ペプチドの試験管内分子進化技術を確立し、多彩な生物活性ペプチドの開発に成功している。しかしながら、親水性の高いアミド結合を主鎖にもつペプチドは、一般的に細胞膜を通過できないため、細胞移行配列など余分な配列に頼らずに細胞内標的を阻害する人工ペプチド薬剤の開発原理は、現時点では存在しない。一方で、天然物ペプチドには、細胞膜を通過できるものも多い。例えば、天然物ペプチドの一種であるチオペプチド群は、細胞内の分子標的を阻害するものが多い。そこで本研究では、望みの標的に結合する人工ペプチドリガンド配列と天然物由来の閉環様式を融合させたキメラペプチドを作製し、細胞内で阻害活性を発揮しうる擬天然チオペプチド薬剤を信頼性良く開発する汎用原理を確立することを目指す。
本研究課題では、他の閉環様式に移植可能な人工アミノ酸配列の取得(計画A)、簡便にキメラペプチドを生産する方法論の確立(計画B)、をそれぞれ順次達成した上で、最終的に設計したキメラペプチドが望みの生物活性を示すことを確認する(計画C)ことを計画している。本年度は、モデルとして設定した標的タンパク質に対する試験管内選択実験(計画A)を行い、当該標的タンパク質に結合しうる人工環状ペプチドの配列を複数取得することに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画Aに係るモデル標的に結合する人工環状ペプチドの配列を複数取得することに成功した。さらに、計画Bに関わるキメラペプチドを簡便に生産する方法論の確立にも着手済みである。

Strategy for Future Research Activity

本年度に取得した複数種類の人工ペプチドリガンド配列をチオペプチドの前駆体ペプチドに移植し、試験管内翻訳後修飾反応によって、人工チオペプチドへと変換されるかどうかを順次評価する。これにより、チオペプチド中へと移植可能な人工ペプチドリガンド配列の同定を行う。

Causes of Carryover

人工環状ペプチド配列の取得に関わる試験管内分子選択実験が想定よりも順調に進行したため、物品消耗品費の支出が抑えられた。余裕ができた物品消耗費は、今年度以降行う予定である移植可能な人工ペプチドリガンド配列の同定実験において、評価するキメラ前駆体ペプチド配列の種類を当初の予定よりも増やすことに充てる。これにより、当研究の実現可能性を引き上げられることが期待できる。

  • Research Products

    (21 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 8 results)

  • [Int'l Joint Research] Univ. of North Carolina at Chapel Hill(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Univ. of North Carolina at Chapel Hill
  • [Journal Article] Exploring the Post-translational Enzymology of PaaA by mRNA Display2020

    • Author(s)
      Fleming, S. R., Himes, P. M., Ghodge, S. V., Goto, Y., Suga, H., Bowers, A. A.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 142 Pages: 5024-5028

    • DOI

      10.1021/jacs.0c01576

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Improved Stability of siRNA-Loaded Lipid Nanoparticles Prepared with a PEG-Monoacyl Fatty Acid Facilitates Ligand-Mediated siRNA Delivery2020

    • Author(s)
      Sakurai, Y., Mizumura, W., Ito, K., Iwasaki, K., Katoh, T., Goto, Y., Suga, H., Harashima, H.
    • Journal Title

      Mol Pharm

      Volume: 17 Pages: 1397-1404

    • DOI

      10.1021/acs.molpharmaceut.0c00087

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ribosomal Formation of Thioamide Bonds in Polypeptide Synthesis2019

    • Author(s)
      Maini, R., Kimura, H., Takatsuji, R., Katoh, T., Goto, Y., Suga, H.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 141 Pages: 20004-20008

    • DOI

      10.1021/jacs.9b11097

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemoenzymatic Posttranslational Modification Reactions for the Synthesis of Psi[CH2 NH]-Containing Peptides2019

    • Author(s)
      Kato, Y., Kuroda, T., Huang, Y., Ohta, R., Goto, Y., Suga, H.
    • Journal Title

      Angew Chem Int Ed Engl

      Volume: 59 Pages: 684-688

    • DOI

      10.1002/anie.201910894

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Meeting Peptides in Kyoto2019

    • Author(s)
      Futaki, S., Matsuzaki, K., Goto, Y.
    • Journal Title

      Chembiochem

      Volume: 20 Pages: 2015-2016

    • DOI

      10.1002/cbic.201900456

  • [Journal Article] Generation of non-standard macrocyclic peptides specifically binding TSC-22 homologous gene-12019

    • Author(s)
      Tran, S. T. P., Hipolito, C. J., Suzuki, H., Xie, R., Kim Tuyen, H. D., Dijke, P. T., Terasaka, N., Goto, Y., Suga, H., Kato, M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 516 Pages: 445-450

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.06.035

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In Vitro Biosynthesis of Peptides Containing Exotic Azoline Analogues2019

    • Author(s)
      Goto, Y., Suga, H.
    • Journal Title

      Chembiochem

      Volume: 21 Pages: 84-87

    • DOI

      10.1002/cbic.201900521

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RiPP生合成経路の改変による天然物ペプチドの人工誘導体の合成2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Journal Title

      ペプチド創薬の最前線, シーエムシー出版

      Volume: n/a Pages: n/a

  • [Journal Article] ケミカルバイオロジー2.02019

    • Author(s)
      三好大輔, 山東信介, 清中茂樹, 花岡健二郎, 後藤佑樹
    • Journal Title

      現代化学

      Volume: 581 Pages: 18-23

  • [Journal Article] RiPP生合成経路の改変による人工ペプチド生産2019

    • Author(s)
      後藤佑樹, 井上澄香, 菅裕明
    • Journal Title

      ファルマシア

      Volume: 55 Pages: 662-667

    • DOI

      10.14894/faruawpsj.55.7_662

  • [Presentation] One-pot saturation mutagenesis of substrate peptides of posttranslationally modifying enzymes2019

    • Author(s)
      Yuki Goto, Haruka Takeue, Yamato Komatsu, Alexander A. Vinogradov, Hiroaki Suga
    • Organizer
      第56回ペプチド討論会
  • [Presentation] ペプチド薬剤を作る人工生合成システム2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      第9回 CSJ化学フェスタ2019 究極の化学がここにある!~自然に学び自然に迫る触媒デザイン~
    • Invited
  • [Presentation] 試験管内人工生合成系で擬天然物を創る2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      理研 Chemical Probe 第二回合同合宿セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 試験管内人工生合成系で擬天然物ペプチドを創る2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      第71回日本生物工学会大会 生合成工学における有用生体機能分子の次世代創製技術
    • Invited
  • [Presentation] 試験管内人工生合成系で擬天然物ペプチドを創る2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      日本遺伝学会第91回大会 WS7 再構成系におけるゲノムの構築・複製・動態
    • Invited
  • [Presentation] Artificial in vitro biosynthesis for elaboration of pseudo-natural peptides2019

    • Author(s)
      Yuki Goto
    • Organizer
      10th RSC-CSJ Joint Symposium _ Chemistry for Complex Biological Systems _
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 化学的骨格変換反応による主鎖修飾ペプチドの翻訳合成2019

    • Author(s)
      後藤 佑樹、黒田 知宏、堤見 遥、加藤 保治、菅 裕明
    • Organizer
      第13回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] プレニル化擬天然ペプチドをつくる2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      細胞構成研究会2019
    • Invited
  • [Presentation] 試験管内人工生合成系で擬天然物をつくる2019

    • Author(s)
      後藤佑樹
    • Organizer
      第7回慶應有機化学若手シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] One-pot saturation mutagenesis of RiPP precursor peptides2019

    • Author(s)
      Yuki Goto
    • Organizer
      First International RiPPs Conference 2019
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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