Functional analyses of endogenous retroviruses expressed in melanoma and their application in veterinary clinical practice.

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K22365
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 42:Veterinary medical science, animal science, and related fields
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: Miyazawa Takayuki 京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 准教授 (80282705)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 水野 拓也 山口大学, 共同獣医学部, 教授 (90398826) ; 中川 草 東海大学, 医学部, 講師 (70510014)
• Project Period (FY): 2019-06-28 – 2022-03-31
• Keywords: 内在性レトロウイルス / イヌ / 口腔悪性黒色腫 / 腫瘍マーカー

Outline of Final Research Achievements

Endogenous retroviruses (ERVs) are remnants of ancestral retroviruses that infected host germ cells in the past. Most ERVs are thought to be non-functional elements, but some ERVs retain open reading frames (ORFs) capable of expressing proteins. The proteins encoded by ERV-ORFs have potential roles in oncogenesis; however, studies on mammals other than humans and mice are limited. Here, we identified ERV-derived genes expressed in canine oral malignant melanoma (OMM). We identified 11 ERV-derived genes in our OMM samples. Differential expression gene analysis revealed that four ERV-derived genes (PEG10, LOC102155597, and two newly identified genes) were upregulated in OMM compared to healthy tissues.

Free Research Field

ウイルス学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

今回の研究では、サンプル数が少ないことと、十分にデザインされた対照群がないことで、いくつかの限界がある。これらは、サンプル収集が飼い犬の病院での手術に依存するという避けられない状況に一部起因している。さらに、RNA-seq解析で同定された転写産物およびタンパク質の発現は、免疫組織学的に検証されていない。しかし、4つのERV由来遺伝子（PEG10、LOC111094052、2つのfragmented-ORF遺伝子）がイヌのOMMで発現していることが明確に示された。これらの結果は、ERVのコピー数が比較的少ないイヌにおいても、ヒトやマウスと同様のERV由来遺伝子が発現していることを示している。