• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Research-status Report

シナプスにおける時・空間近接分子群の同定手法の開発

Research Project

Project/Area Number 19K22439
Research InstitutionNational Institute for Physiological Sciences

Principal Investigator

深田 優子  生理学研究所, 分子細胞生理研究領域, 准教授 (40416186)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
Keywordsプロテオミクス
Outline of Annual Research Achievements

生体蛋白質は時々刻々と多様な分子群と相互作用することにより、成熟、輸送を経て適所に局在化することで、生理機能を発揮する。これらいずれの過程が障害されても蛋白質はその機能を果たせず、時には疾患の要因となる。したがって、生体蛋白質、とりわけ疾患関連蛋白質の相互作用分子を時・空間的解像度を上げて同定することは、極めて重要である。近年のプロテオミクス解析技術は大きく進歩したが、(1)不溶性が高い細胞膜やオルガネラ特異的に起こる蛋白質相互作用、(2)細胞種特異的な蛋白質相互作用や(3)酵素と基質間結合のような一過的な蛋白質相互作用の全容に関しては未だ十分に解明されていない。本研究では、てんかん関連リガンドLGI1とその受容体ADAM22、さらには蛋白質の膜局在に重要な役割を担うパルミトイル化脂質修飾関連酵素をモデル蛋白質として、超解像プロテオミクス法の開発に挑戦する。これまで見過されてきた蛋白質相互作用を明らかにして、シナプス制御機構やシナプス病態機構の理解につながる成果を得る。
2019年度は、タンパク質相互作用を維持した状態で、シナプス不溶性画分からタンパク質複合体を可溶化、精製することが可能な実験条件(界面活性再の種類と濃度)を確立した。そして、脳シナプス膜画分におけるADAM22タンパク質複合体を効率良く、網羅的、特異的に同定することに成功した。また、タグ付きパルミトイル化脂質修飾関連酵素のノックインマウス脳から、多くの相互作用分子を精製、同定した。さらに、神経細胞種特異的なシナプスタンパク質複合体の同定技術の開発に取り組み、実験ツールを得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1) シナプス不溶性画分からタンパク質複合体を可溶化、精製することが可能な実験条件を確立し、新たなADAM22タンパク質複合体を精製、同定した。
(2) タグ付きパルミトイル化脂質修飾関連酵素のノックインマウス脳から、多くの相互作用分子を精製、同定した。
(3) 神経細胞種特異的なシナプスタンパク質複合体の同定に必要な実験ツールを得た。

Strategy for Future Research Activity

(1) 2019年度に同定した新たなADAM22タンパク質複合体の機能解析を進める。
(2) 2019年度に同定したパルミトイル化脂質修飾関連酵素の相互作用分子の機能解析を進める。
(3) 神経細胞種特異的なADAM22やLGI1の相互作用分子を同定する。

Causes of Carryover

(理由)準備済みのリソースを用いて効率よく実験をおこなえたことにより、予定していた物品費の執行が減少した。
(使用計画)新たに同定した相互作用分子の機能解析に必要となる物品費(神経細胞培養やイメージング等)およびその他(分析室使用料など)として、計画的に執行する。

  • Research Products

    (16 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] UCSF(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      UCSF
  • [Int'l Joint Research] Institut Curie(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institut Curie
  • [Int'l Joint Research] DZNE(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      DZNE
  • [Int'l Joint Research] UCL Institute of Neurology(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      UCL Institute of Neurology
  • [Int'l Joint Research] University of Helsinki(フィンランド)

    • Country Name
      FINLAND
    • Counterpart Institution
      University of Helsinki
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      1
  • [Journal Article] The extracellular domain of angulin-1 and palmitoylation of its cytoplasmic region are required for angulin-1 assembly at tricellular contacts2020

    • Author(s)
      Oda Yukako、Sugawara Taichi、Fukata Yuko、Izumi Yasushi、Otani Tetsuhisa、Higashi Tomohito、Fukata Masaki、Furuse Mikio
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Pages: 4289~4302

    • DOI

      doi:10.1074/jbc.RA119.010491

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human Cerebrospinal Fluid Monoclonal LGI1 Autoantibodies Increase Neuronal Excitability2020

    • Author(s)
      Kornau Hans‐Christian、Kreye Jakob、Stumpf Alexander、Fukata Yuko、Parthier Daniel、Sammons Rosanna P.、Imbrosci Barbara、Kurpjuweit Sarah、Kowski Alexander B.、Fukata Masaki、Pruss Harald、Schmitz Dietmar
    • Journal Title

      Annals of Neurology

      Volume: 87 Pages: 405~418

    • DOI

      doi: 10.1002/ana.25666

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dynamic palmitoylation controls the microdomain localization of the DKK1 receptors CKAP4 and LRP62019

    • Author(s)
      Sada Ryota、Kimura Hirokazu、Fukata Yuko、Fukata Masaki、Yamamoto Hideki、Kikuchi Akira
    • Journal Title

      Science Signaling

      Volume: 12 Pages: eaat9519

    • DOI

      doi: 10.1126/scisignal.aat9519

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ABHD10 is an S-depalmitoylase affecting redox homeostasis through peroxiredoxin-52019

    • Author(s)
      Cao Yang、Qiu Tian、Kathayat Rahul S.、Azizi Saara-Anne、Thorne Anneke K.、Ahn Daniel、Fukata Yuko、Fukata Masaki、Rice Phoebe A.、Dickinson Bryan C.
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 15 Pages: 1232~1240

    • DOI

      10.1038/s41589-019-0399-y

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Targeting CCR5 trafficking to inhibit HIV-1 infection2019

    • Author(s)
      Boncompain Gaelle、Herit Floriane、Tessier Sarah、Lescure Aurianne、Del Nery Elaine、Gestraud Pierre、Staropoli Isabelle、Fukata Yuko、Fukata Masaki、Brelot Anne、Niedergang Florence、Perez Franck
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 5 Pages: eaax0821

    • DOI

      10.1126/sciadv.aax0821

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Systematic Screening of Depalmitoylating Enzymes and Evaluation of Their Activities by the Acyl-PEGyl Exchange Gel-Shift (APEGS) Assay2019

    • Author(s)
      Kanadome Takashi、Yokoi Norihiko、Fukata Yuko、Fukata Masaki
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: - Pages: 83~98

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-9532-5_7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deleted in colorectal cancer (netrin‐1 receptor) antibodies and limbic encephalitis in a cat with hippocampal necrosis2019

    • Author(s)
      Hasegawa Daisuke、Ohnishi Yumi、Koyama Eiji、Matsunaga Satoru、Ohtani Shouhei、Nakanishi Akio、Shiga Takanori、Chambers James K.、Uchida Kazuyuki、Yokoi Norihiko、Fukata Yuko、Fukata Masaki
    • Journal Title

      Journal of Veterinary Internal Medicine

      Volume: 33 Pages: 1440~1445

    • DOI

      10.1111/jvim.15492

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Physiological roles of trans-synaptic LGI1-ADAM22-MAGUK complex2019

    • Author(s)
      Fukata Yuko、Hirano Yoko、Inahashi Hiroki、Miyazaki Yuri、Yokoi Norihiko、Sanbo Makoto、Goto Teppei、Hirabayashi Masumi、Fukata Masaki
    • Organizer
      Neuroscience Meeting SfN 2019
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functions of trans-synaptic protein complex of epilepsy-related ligand-receptor, LGI1 and ADAM222019

    • Author(s)
      Fukata Yuko
    • Organizer
      McGill-NIPS Joint Workshop
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      https://www.nips.ac.jp/fukata/

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi